DNA芯片绘制出染色质结合位点

　　

中华基因网消息：染色质蛋白与DNA转录，复制和修复有关，通过结合到特殊染色体位点上完成它们的功能。确定染色质的结合位点将为研究个别染色质蛋白功能机制提供方向，但是现有检测位点的方法需要花费大量的人力物力。在4月出版的《自然 遗传学》上，Fred Hutchinson癌症研究中心的研究人员利用最新的DNA芯片技术绘制了染色质结合位点图谱。

在过去的研究中，研究人员常常将大肠杆菌酶DNA腺嘌呤转甲基酶（Dam）融合到不同的染色质蛋白中。细胞中的表达开始后，这些甲基化DNA会出现在染色质蛋白结合位点的周围。

在新研究中，作者描述了如何利用基因芯片大量绘制这些甲基化位点的方法。使用这种方法，小的甲基化片断能从单独表达Dam酶或是特殊Dam染色质融合物的细胞中分离出来。这些DNA片断用Cy3或是Cy5荧光标记后，在芯片上进行杂交。

为了测试这项技术，作者将三种不同的染色质蛋白与Dam融合，绘制了所有的结合位点图谱。这项新技术为绘制染色质蛋白和其他DNA结合蛋白位点提供了有用的工具。