后基因组时代的药物设计

　　

新生命网站全国首届生物信息学大会报道：人类基因组及其它基因组测序工作的进行为新药研制提供了许多潜在的靶点。这些潜在的靶点一方面为制药业创造了前所未有的机会，另一方面也带来了严峻的考验。传统药物设计的出发点是单一的药物作用靶点，以此进行先导化合物的实验或计算机筛选。后基因组时代为我们提供了大量靶点的信息，同时这些信息又是不完整的，很多时候甚至对于靶点的结构和功能还不清楚。因此迫切需要发展能够适应这种要求的新的药物设计方法。

针对后基因组时代药物设计的需要，我国科学家已经建立了与人类疾病相关的蛋白质结构数据库（HDRPD），发展了能够快速进行小分子化合物与蛋白质结合部位匹配的方法 。HDRPD目前包括9大类249个蛋白质的结构及相关信息，可以进行关键词查询及结合匹配计算，并将随着结构基因组的进行和数据的积累逐步进行扩充。该数据库将对于天然产物生物活性的计算机筛选、现有药物毒副作用的研究及蛋白质作用网络研究等提供基础。

后基因组中一个重要的方面是蛋白质功能的研究。随着结构基因组的进行，实验测定蛋白质结构的速度逐步加快。越来越多的蛋白质在测定空间结构后尚不清楚其生物功能。因此蛋白质功能预测日益受到重视。研究者将利用所发展的基于关键作用部位的筛选方法进行蛋白质功能的预测。