-
生物通官微
陪你抓住生命科技
跳动的脉搏
炭疽基因组测序完成,为炭疽传染提供线索
【字体: 大 中 小 】 时间:2001年11月28日 来源:
编辑推荐:
炭疽病毒全基因组序列信息有望在未来几个月内为解释这种传染病如何致命以及如何最有效抵抗传染病提供新的线索--这是研究人员 Kathryn Beauregard在《科学》杂志的“功能基因组学”网站上公布的。
来自Emory大学的Beauregard调查了当前可获得的有关炭疽病毒的遗传信息,以及要识别、预防和治疗炭疽热需要何等基础的基因组学研究。
“B. anthraci基因组测序的完成将加强炭疽细菌毒性、流行性以及生理学上的研究。”Beauregard在这篇在线发表的综述性文章中写道。
Bearegard解释说,和炭疽热细菌相近的细菌具有含标记基因的质粒——这是独立于细菌基因组以外自我复制的DNA环状分子,能产生杀虫效应的著名苏云金杆菌Bacillus thringiensis,其毒素基因就位于质粒上。炭疽热细菌Bacillus anthracis的大多数毒性因子的基因也一样。
迄今,炭疽细菌质粒pX01和pX02已被测序。
pX01和pX02质粒分别含有负责编码炭疽毒素和抗毒素物质的基因。pX01主要编码对宿主造成损害的毒素,pX02则编码抵抗来自宿主细胞的攻击——正常情况下,这些宿主细胞可以吞嗜或破坏掉细菌。据Beauregard 讲,pX01 质粒含有一个“病原岛”,这个大片DNA区显示炭疽毒性来源于某些不相关生物体。pX01 病原岛具有44,800个 核苷酸,包含有毒素基因、毒素基因调控因子以及萌发反应基因。“事实上,炭疽病原岛的侧翼由几乎完全一致的反向插入序列包围着。这些插入序列可作为早先发生DNA易位所留下的”足迹“,易位提示病原岛是从某个其他地方而来,也许来自于另一 种细菌。
炭疽细菌以及其它有关的细菌种类曾一度有着共同的遗传资源库或变迁的遗传信息。当某些基因结合到炭疽细菌自身的基因组时,似乎恰好为B. anthracis提供了致死性所需的元素,Beauregard说。
可能还存在其它尚未识别的毒素因子,她继续说。通过比较炭疽细菌毒素基因与其破坏性较小的亲缘种--B. thuringiensis 和 Bacillus cereus(该细菌引起食物中毒)的类似基因,一个全炭疽基因组可以告诉科学家那些破坏性小的炭疽菌株到底丢失了什么使得它们可以被用作疫苗——如果它们确实失去了某些因子。另外,炭疽基因组有助于分析炭疽的基因表达,查明导致疾病的确切基因和蛋白质。
据Beauregard,称,炭疽基因组还有助于识别特殊炭疽菌株,她认为B. anthracis是已知变异最小的细菌种类之一。这意味着菌株之间的差异是由相对较少数量的DNA 维系着。当前辨别最近炭疽邮件事件中的炭疽的方法是识别主要来自两个质粒和其他DNA片段的称为变量串联序列( variable-number tandem repeats ,VNTRs)的DNA信号序列。”全基因组序列将会促进识别其它的VNTRs以及内部标记的发育,从而使病人和环境样品的菌株识别更精确。“Beauregard在综述中写道。
对于最近的公共健康袭击的炭疽检测的原始数据指明了一个有趣的进化史。检测的细菌显示对青霉素有抗性,然而,它们体内并没有ß内酰胺酶——一种可以阻止青霉素效力的酶。科学家发现了两个天然的编码该抗性酶的遗传信号。
最后,Beauregard作出结论:”这项工作的展开是建立在一项令人兴奋的研究的强大基础之上的,该研究鉴别出可能会作为未来疫苗和疗法的目标耙的重要毒素因子,记住这一点很重要。“
生物通摘译自 BIO.COM