致死性细菌基因组测序完成

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当考虑到细菌遗传密码时,细菌基因组的大小可能是一个重要因素。新完成的绿脓杆菌DNA测序展示了一个大的,复杂的基因组,从而可以解释细菌拥有的天然的抗生素和消毒剂抗性。测序结果也可能暴露出了该致死性细菌的弱点。

假单胞菌在浴帘上,泥土中和水中大量繁殖。这种细菌不会对大部分人的健康造成威胁,但是却可以在艾滋病患者和烧伤病人——他们的免疫系统薄弱,中引起致死性的感染。假单胞菌对人类造成最大危害的情况是进入人类肺部引起囊性纤维化的情况。这种情况下几乎不可能清除这种细菌而且经常会造成患者的死亡。假单胞菌的适应性是使其成为这样一种可怕病菌的原因之一。由于这种细菌可以在这么多环境下繁殖,华盛顿大学的遗传学家Maynard Olson说:“这种细菌是细菌世界中的蟑螂。”

8月31日出版的《Nature》杂志上Olson的研究组报道了假单胞菌的基因组测序结果,表明这种细菌有许多生存工具。该基因组较目前已测序的其它微生物基因组所含DNA多3到4倍,并且充满有用基因,而只有相对少量的无用DNA。已经鉴定了5500个基因。其中有一大部分是所谓的命令和控制基因,它们帮助细菌决定是形成克隆还是继续寻找更好的生存地点,这可能使得假单胞菌较其它细菌“更聪明”。许多基因编码构成吐出外源分子——可能包括抗生素——以使细菌解毒的分子泵的蛋白。

由于获得了该细菌的基因组序列,研究者们希望设计出对抗这种细菌的更好的武器。依阿华大学微生物学家Peter Greenberg说:“该基因组序列帮助我们设计出一些难以置信的工具,并且提出一系列基因功能和如何阻止其发挥功能的假设。”

——摘译自8月31日ScienceNow

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