美即将在一个月内完成数个微生物基因组测序

【字体: 时间:2000年08月31日 来源:

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由于美国能源部联合基因组研究所(JGI)承担的人类基因组测序任务已经接近尾声,他们决定在一个月内完成17个微生物基因组的测序。

据JGI的Trevor Hawkins说,由于微生物基因组通常小于1000万碱基,因此解码这些基因组与组装大至30亿碱基的人类基因组相比应该是简单而迅速的。他预计加州Walnut Creek的实验室一天完成200万碱基的测序应当是不成问题的,这可以确保他的研究组通读每个微生物DNA6或8次。他们计划在10月起始这项计划。JGI将在其新“Genome Portal”网页上公布他们的微生物基因组草图。

在JGI的测序名单上有两个植物病原体和几个固氮或碳的细菌,其它两个是具磁性的微生物。波士顿Tufts大学医学院的遗传学家Stuart Levy希望优先测序一种生活在土壤中的假单胞菌,因为这种细菌可以分解污染物。

——摘译自8月29日ScienceNow

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