斯坦福研究者研制出含有几乎全部的线虫基因的芯片

　　

纽约消息：斯坦福大学医学中心的研究者本周二说他们已经建立了含有线虫Caenorhabditis elegans94%基因组的DNA芯片。

研究者使用微阵列研究C.elegans发育过程中的基因表达和两种性别的基因表达，并且发现了总共2171个性别调控的基因。据领导这项研究的Stuart Kim说，相对于以前已知的少数目标而言，这是一个明显的增加。

被广泛研究的模型生物C.elegans，其全基因组在1998年被测序，是基因组有如此大部分包括在芯片中的第一个生物。斯坦福的微阵列含有C.elegans基因组目前被注释的18967个基因中的17871个基因。该研究的所有细节将发表在1月2日出版的Proceedings of the National Academy of Sciences上。

含有全部基因组的如此大规模的DNA微阵列对研究基因表达模式而言将是必须的，而后者是使用基因组测序数据研究基因功能的下一步。

Kim说：“基因组之前，你将会考虑那些基因编码的是什么蛋白，然后是如果敲除基因将会发生什么？基因组之后，你将有大量的被调控的基因的表达数据……不管你所研究的是什么基因，都存在一个可以用来说明这些基因如何工作的表达字典。”

其它研究C.elegans的实验室将可以获得这种芯片，它们将自己制备RNA，而微阵列实验将在斯坦福完成，而结果将公布在网上的斯坦福线虫芯片数据库（http://www.genomeweb.com/article/）。

斯坦福的研究是紧接着基因组研究所和哈佛大学发表在10月的Science上的工作之后，第二个在一个芯片上包括几乎全部C.elegans基因组的工作。

——摘译自12月26日