中国与丹麦携手破解猪基因组

【字体: 时间:2000年11月09日 来源:

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北京消息:中国和丹麦已经开始合作,进行猪基因组测序计划。该计划将耗时7年,到完成时将是第一个完成测序的家畜基因组,并且是继人类,小鼠和大鼠之后的第四个完成测序的哺乳动物基因组。合作的参与者希望由该计划得到的信息将为两国的猪饲养业,以及基础科学和医学提供帮助。

在该计划中,丹麦动物科学研究所,皇家兽医和农业大学(KVL)以及丹麦养猪业的代表将与中科院(CAS)北京基因组研究所(BGI)进行合作。四个机构的领导在10月20日在北京进行的会谈中达成了协议。BGI的所长杨焕明说,这项合作是中国强大的测序能力和丹麦猪饲养技术及比较和功能基因组研究经验的“完美结合”。丹麦猪基因组联合会主席,KVL前院长Torben Greve说:“我们为了签署一项协议来到这里,我们对结果非常满意。”

合作的双方面同意分享计划一期阶段的1500万美元费用,该阶段为期三年,计划进行有价值基因的鉴定,开发物理和遗传图谱标记,提供异种移植研究工具。第二阶段耗时更长,费用高达6000万美元,以覆盖90%序列和95%基因的工作图谱为目的。估计猪基因组含30亿碱基。

BGI将利用一台超级计算机和多于100台的最新毛细管测序仪,完成测序和序列分析的工作。BGI的代理负责人于军说,BGI计划对45台国际人类基因组计划中使用的机器进行重新分配。丹麦将负责寻找有价值性状,如疾病抗性,生长和小外形,的遗传标记。他们的科学家将构建100个含帮助合作的其他科学家鉴定全长基因的部分基因序列的cDNA克隆文库。

双方同意初期投资200万美元。CAS已经提供给北京的研究所资金。丹麦科研和食品,农业,渔业部门希望为在丹麦进行的研究提供资金,但是丹麦产猪协会和肉类委员会将提供资金给BGI的测序组。

研究者们希望可以获得科学界能够立即使用的序列数据,并且遵守人类基因组计划中使用的百慕大条约。但是工业界的投资者要求结果推迟数月公布。杨焕明说:“双方在要求24小时内立刻公布结果的百慕大条约,与其它私人机构为了保护商业应用使用的数据公布政策之间达到了一个折中。”

尽管如此,合作的参与者说他们仍然坚持结果共享的观点。丹麦国家委员会的Orla Gron Pederson说:“该计划和其它国际间合作计划一样,不会有什么新的限制。”杨焕明说,数据公布,以及科学研究物资供应,知识产权和将来的合作者的最终条件还没有定出。据他透露,新加坡和法国的研究所已经表示了参与该项目的兴趣,但是目前由于缺少资金而不能参与。

CAS生命科学部主席称,该计划标志着中国朝国家资源基因组测序迈出的“重要一部”。这是中国生物资源基因组计划中,继决定测序中国超级杂交稻(Science, 5 May, p. 795)之后的第二个项目。丹麦官员希望使用获得的知识来序进该国生物信息学研究,并加强国家猪肉生产工业。对猪基因组的进一步了解,也促进了转基因动物用于器官移植来源,疾病模型和医药的生产。

——摘译自11月3日《Science》Vol.290,No.5493,p.913-914

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