编辑推荐：
为探究儿科肿瘤中 ERK 磷酸化（pERK）水平与基因组 MAPK 通路改变的相关性，以寻找 MAPK 靶向治疗潜在靶点，研究人员分析 PTT2.0 登记处数据。结果显示二者有关联但 pERK H 评分预测 MAPK 改变能力低，该研究为儿科肿瘤诊疗提供新思路。
在儿童肿瘤的研究领域，一直存在着诸多亟待解决的难题。儿童肿瘤患者的预后常常不容乐观，传统治疗手段对部分患儿效果欠佳。而随着分子诊断时代的到来，精准治疗成为可能，探寻肿瘤中的可作用靶点，开发更有效的疗法，成为医学研究的关键方向。其中，丝裂原活化蛋白激酶（MAPK）通路在儿科癌症中频繁出现改变，是极具潜力的可作用靶点。然而，MAPK 通路激活的 “功能” 标记 ——MAPK 下游效应因子细胞外信号调节激酶（ERK）的磷酸化水平（pERK），与基因组 MAPK 通路改变之间的关系尚不明确，这阻碍了基于 MAPK 通路的精准治疗进一步发展。
为了攻克这些难题，来自德国多个研究机构的研究人员，包括 Hopp 儿童癌症中心海德堡（KiTZ）、德国癌症研究中心（DKFZ）等，开展了一项针对儿科肿瘤的研究。他们以 PTT2.0 登记处的数据为基础，深入探究 “基因组 MAPK 改变” 和 “pERK 水平” 在复发儿科癌症中的相关性。该研究成果发表在《Scientific Reports》上，为儿科肿瘤的治疗带来了新的希望和方向。
研究人员在开展研究时，主要运用了以下几种关键技术方法：首先，获取 PTT2.0 登记处研究队列中福尔马林固定石蜡包埋（FFPE）的肿瘤样本数据，这些样本涵盖多种肿瘤类型；其次，进行组织病理学和分子诊断，通过基因 panel 测序、DNA 甲基化分析等检测基因组肿瘤改变，利用免疫组化测定 pERK H 评分；最后，运用 R Studio 进行统计分析和数据可视化，采用逻辑回归分析等方法探究变量间的关系。
下面来看具体的研究结果：
- 基因组 MAPK 改变的丰度和 ERK 的整体磷酸化状态：研究人员对 PTT2.0 队列中 235 例具有可用基因 panel 测序数据、DNA 甲基化数据和免疫组化数据的样本进行分析。在这些样本中，6% 的样本仅有 MAPK 通路上游酪氨酸激酶激活改变，10% 的样本存在 MAPK 通路激活改变，且未发现同时在这两类有改变的样本。此外，队列中 MAPK 通路下游效应因子 ERK 磷酸化的 H 评分中位数为 30，范围在 0 - 240 之间。
- 基因组 MAPK 改变与 ERK 磷酸化状态的关联：研究发现，存在 MAPK 通路改变的样本，其平均 pERK H 评分显著高于无 MAPK 通路改变或仅有受体酪氨酸激酶（RTK）改变的样本。在不同肿瘤类型中，低级别胶质瘤（LGG）和室管膜瘤（EPN）的 pERK H 评分最高。其中，LGG 样本中有较高比例的 MAPK 改变，而 EPN 样本中则不存在 MAPK 改变。通过二元逻辑回归分析，pERK H 评分与 MAPK 改变的存在呈显著正相关，但 pERK 预测 MAPK 改变的敏感性仅为 58.3%，特异性为 83.8%。
综合上述研究，研究人员得出结论：在儿科癌症中，pERK H 评分与遗传 MAPK 改变之间的关联并不紧密。一些肿瘤虽缺乏基因组 MAPK 改变，但 pERK 水平较高，这表明 MAPK 激活在儿科癌症中可能独立于基因组改变发生；而部分存在已知 MAPK 激活基因组改变的病例，pERK 水平却较低，这对 pERK 作为 MAPK 通路活性单一可靠标记的有效性提出了挑战。
在讨论部分，研究人员指出，PTT2.0 登记处检测 MAPK 改变的方法可能存在不足，部分相关基因融合可能未被检测到。同时，pERK 水平受多种因素影响，如 MAPK 通路的反馈机制等。未来，基于基因表达的评分，如 MAPK 活性评分（MPAS）或 MAPK 抑制剂敏感性评分（MSS），有望在儿科肿瘤诊断中发挥更大作用，帮助医生更准确地判断 MAPK 通路的激活情况，以及更合理地使用 MAPK 抑制剂治疗缺乏预测性 MAPK 改变的肿瘤。这项研究为儿科肿瘤的分子诊断和靶向治疗提供了重要依据，推动了儿科肿瘤精准医疗的发展，为改善儿童肿瘤患者的预后带来了新的曙光。
