两种F1分枝杆菌噬菌体Deb65和DocMcStuffins的基因组特征与进化意义解析

来自威廉玛丽学院的研究团队通过分离湿地土壤中的两种新型噬菌体，揭示了分枝杆菌噬菌体多样性。研究采用Illumina MiSeq测序和生物信息学分析，鉴定出Deb65（55,767bp）和DocMcStuffins（58,159bp）均属于F1亚群，共享41个核心基因。该发现为理解分枝杆菌（Mycobacterium smegmatis）的噬菌体-宿主互作机制提供了新视角，对开发噬菌体疗法具有潜在价值。

　　在威廉玛丽学院潮湿的淤泥土壤中，科学家捕获了两只形态优雅的"细菌猎手"——Deb65和DocMcStuffins。通过透射电镜（TEM）观察，这对噬菌体展现出典型的siphovirus形态：直径约50nm的二十面体头部搭配180-190nm的柔韧尾部。基因组测序揭示它们分别携带97和91个预测基因，其中41个核心基因编码着病毒组装、裂解和溶原化的关键元件。特别有趣的是，虽然两者酪氨酸整合酶（tyrosine integrase）具有90%的氨基酸一致性，但免疫阻遏蛋白仅共享39%相似度，暗示着精细调控的宿主适应策略。通过Phamerator比对和基因内容相似性（GCS）分析，研究者将这对噬菌体归类于F1亚群，其基因组后半段独特的糖基转移酶和DNA甲基转移酶（仅Deb65携带）为噬菌体进化研究提供了新线索。这项研究不仅扩充了Actinobacteriophage数据库资源，更为理解分枝杆菌mc²155的噬菌体防御机制开辟了新路径。