苏必利尔湖南岸支流河口富集微生物群落扩增子测序揭示藻华形成机制

【字体: 时间:2025年04月15日 来源:Microbiology Resource Announcements 0.7

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  来自威斯康星大学麦迪逊分校的研究人员针对苏必利尔湖南岸近年突发藻华现象,通过16S rRNA扩增子测序分析15个支流河口的富集微生物群落(含过滤/非过滤水体),揭示了陆源输入对湖泊微生物群落结构的影响(Bray-Curtis NMDS显示β多样性差异),为解析气候变暖与人为径流驱动藻华(algal blooms)的机制提供了关键数据支撑。

  在苏必利尔湖南岸支流河口的15个采样点,科学家们展开了一场微生物"侦探行动"。通过采集表层原水(bulk water)和100微米不锈钢筛网过滤水,研究团队利用BG-11培养基在12小时光暗循环条件下进行30天富集培养。随后采用V4区16S rRNA基因扩增子测序(Illumina Miseq v2平台),结合Silva 138.1数据库进行物种注释,最终获得925,380条高质量序列(平均每个样本15,955条reads)。有趣的是,过滤水样本的Shannon多样性指数(3.02)略高于原水样本(2.83),而基于Bray-Curtis相异度的NMDS分析则清晰展现了两种水体的微生物群落结构差异。这些数据如同微生物界的"指纹库",为破解支流输入如何影响湖泊微生物生态、进而诱发藻华提供了重要线索。研究还发现,所有样本的测序覆盖度高达99.3%,鉴定出4,232个97%相似度的OTUs,其中蓝藻相关类群的动态变化尤为值得关注。
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