海马育幼袋共生菌Mesonia hippocampi基因组草图揭示其与宿主健康的潜在关联
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时间:2025年04月07日
来源:Microbiology Resource Announcements 0.7
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来自美国能源部联合基因组研究所等机构的研究人员为解决海马育幼袋微生物组与宿主健康的关系问题,对分离自患病海马(Hippocampus barbouri)育幼袋的Mesonia hippocampi DSM 29568T菌株进行全基因组测序。获得498,773,430 bp基因组(含2,377个蛋白编码基因),发现其编码维生素合成酶及抗氧化基因,为理解共生菌-宿主互作机制及海马保育策略提供新见解。
科研人员首次解析了从患病海马(Hippocampus barbouri)育幼袋分离的Mesonia hippocampi DSM 29568T菌株基因组特征。该革兰氏阴性杆状菌属于黄杆菌科(Flavobacteriaceae),其2.59 Mb基因组(GC含量34.48%)通过Illumina NovaSeq平台测序,经SPAdes组装后显示575.6×覆盖度及97.38%完整性。基因组分析揭示该菌含2,344个蛋白编码基因,其中23.35%与KEGG通路相关,特别鉴定出参与硫胺素、生物素等水溶性维生素及维生素K合成的关键酶系,同时携带超氧化物歧化酶(SOD)和过氧化氢酶(CAT)基因,暗示其可能在宿主氧化应激调控中发挥作用。值得注意的是,该菌过度增殖可能导致育幼袋炎症及气肿——这种现象与其特殊的代谢能力相关。研究采用MasterPure DNA提取试剂盒制备文库,经Kapa Biosystems建库后获得6,557,288条双端读长,CheckM评估显示仅0.19%污染率。该发现为理解海洋鱼类共生菌功能及海马保育医学提供了重要分子基础。
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