小鼠全脑单细胞分辨率空间转录组图谱

《Neuro》Single-cell spatial transcriptomic atlas of the whole mouse brain

为全面了解大脑功能，研究人员运用 snRNA-seq 和 Stereo-seq 技术构建小鼠脑图谱，揭示多层面信息，意义重大。

　　

亮点：小鼠大脑单细胞分辨率全转录组空间图谱；揭示区域和亚区域富集的编码基因与长链非编码 RNA（lncRNAs）；基于基因的分区揭示多个脑区精细结构组织；转录因子调控子在小鼠大脑发育中展现时空动态变化。
摘要：全面了解哺乳动物全脑的基因、细胞类型及其空间分布图谱，是理解大脑功能的基础。研究人员利用单核 RNA 测序（snRNA-seq）和 Stereo-seq 技术，生成了具有单细胞分辨率的小鼠脑图谱。该图谱涵盖 308 个细胞簇、400 多万个细胞以及 29,655 个基因的空间信息。研究人员识别出偏好皮质亚区域的细胞簇，并探究其与脑相关疾病的关联；在脑干中精准定位 155 个具有独特区域表达模式的基因，还发现 513 个在成人大脑中区域富集表达的长链非编码 RNA。基于空间转录组信息对脑区进行分区，揭示了多个脑区的精细结构。此外，研究人员还发现 411 个转录因子调控子在神经发育过程中呈现明显的时空动态变化。由此，构建出覆盖全基因组的小鼠大脑单细胞分辨率空间转录组图谱。