《Cell Reports》:The metabolic sensor LKB1 regulates ILC3 homeostasis and mitochondrial function
编辑推荐:
本文揭示 LKB1 对成年 ILC3 稳态、功能至关重要,为肠道免疫和相关疾病研究提供关键依据。
引言
天然淋巴细胞(ILCs)是一类组织驻留的固有免疫细胞,与适应性 T 细胞功能互补。其中,3 型天然淋巴细胞(ILC3s)表达 RORγt,能产生白细胞介素 - 22(IL-22)和 IL-17,在肠道黏膜中含量丰富,对维持肠道上皮稳态、抵御细菌感染等发挥着重要作用。
代谢和线粒体功能对免疫细胞的命运和免疫反应有着深远影响。例如,CD4+辅助性 T(Th)细胞分化依赖于雷帕霉素靶蛋白(mTOR)相关的高糖酵解活动,而调节性 T(Treg)细胞则依赖脂肪酸氧化(FAO)。ILC3s 与 Th17 细胞类似,主要通过有氧糖酵解和 mTOR 信号满足能量需求,且 ILC3s 需要更高的线粒体活性氧(mROS)水平来维持缺氧诱导因子 1α(HIF1α)依赖的基因表达程序。
肝脏激酶 B1(LKB1)作为一种应激和能量传感器激酶,能激活 AMP 激活的蛋白激酶(AMPK)及相关激酶,调控细胞代谢、增殖和极性。已有研究表明,LKB1 在多种免疫细胞的发育和功能中发挥重要作用,如调节 Treg 细胞功能、影响 Th17 细胞效应程序等。然而,LKB1 在 ILC3s 中的作用此前尚未被研究。
结果
- ILC3 特异性 LKB1 缺陷减少成年 ILC3 数量和 IL-22 产生:研究人员通过将Stk11fl和Rorc-cre 小鼠杂交,构建了 ILC3 特异性 LKB1 缺陷小鼠模型。在缺乏 T 和 B 细胞的Rag2缺陷背景下,与对照组相比,LKB1 缺陷小鼠小肠中 ILC3s 的比例和数量显著降低,包括 CCR6+、CCR6?NKp46?和 CCR6?NKp46+等亚群。此外,LKB1 缺陷的 ILC3s 中 RORγt 表达水平降低,体外再刺激后细胞因子反应改变,IL-17A 比例增加,IL-22 产生减少,导致 IL-17A+和 IL-22+ ILC3 数量总体下降。这一现象在结肠、肠系膜淋巴结和脾脏等器官中也得到了证实。而在胚胎期,LKB1 缺失对胎儿淋巴组织诱导细胞(LTi)的数量没有影响。竞争性骨髓移植实验表明,LKB1 对成年 ILC3 的维持具有细胞内在性。
- Stk11Δ ILC3s 对细菌感染的反应能力受损:ILC3s 在肠道感染的免疫反应中至关重要。研究发现,感染肠道病原体Citrobacter rodentium 7 天后,Stk11Δ小鼠体重迅速下降,结肠缩短,结肠炎评分增加,上皮屏障功能障碍加剧,细菌易位至肝脏。同时,Stk11Δ小鼠结肠中 IL-17 和 IL-22 表达的 ILC3s 比例和数量均减少,表明 ILC3s 需要功能性 LKB1 来有效应对肠道感染。
- LKB1 抑制增殖并促进 ILC3 存活:对Stk11+和Stk11Δ ILC3s 进行批量 RNA 测序分析,发现 LKB1 缺陷导致 ILC3s 在多个生物学过程发生改变,包括免疫和炎症反应增强、细胞周期和凋亡失调、代谢过程和能量产生减少、脂质代谢失衡等。细胞周期相关基因和抗凋亡与促凋亡 Bcl2 家族基因表达失衡,表明 LKB1 缺陷的 ILC3s 增殖增加但凋亡也增多。通过流式细胞术验证,LKB1 缺陷的 ILC3s 中 Ki-67 表达升高,凋亡细胞比例增加,解释了 ILC3 数量减少的原因。
- ILC3s 需要 LKB1 来维持有效的线粒体功能、脂质代谢和能量产生:转录组学分析显示,与对照组相比,Stk11Δ ILC3s 中糖酵解、三羧酸循环(TCA)、线粒体脂肪酸氧化(FAO)、线粒体核糖体和氧化磷酸化(OXPHOS)相关基因表达失调,提示 LKB1 缺失导致 ILC3s 线粒体功能受损和代谢紊乱。通过流式细胞术、透射电镜等实验证实,LKB1 缺陷的 ILC3s 线粒体质量减少、膜电位异常、脂质积累增加。代谢分析表明,LKB1 缺陷的 ILC3s 线粒体依赖性降低,糖酵解能力增加,基础翻译速率显著降低,表明 ILC3s 需要 LKB1 维持代谢稳态。
- 调节 LKB1 下游靶激酶可调节 ILC3 的 IL-22 产生:ILC3s 主要由细胞因子激活,研究发现 IL-23 和 IL-1β 刺激可增加 ILC3s 中 LKB1 的磷酸化。LKB1 通过调节下游 AMPK 及相关激酶家族影响细胞功能。研究人员检测了 LKB1 靶激酶在 ILC3s 中的表达,并使用激酶抑制剂和激活剂进行体外实验。结果显示,MARK 抑制剂处理后,ILC3s 活细胞数量减少,IL-22 产生降低;而 LKB1-AMPK 信号激活剂 AICAR 处理则增加了 IL-22 的产生。这表明 LKB1 信号参与 ILC3 激活,其下游靶激酶 MARKs 对 IL-22 产生起调节作用。
- LKB1 缺失增加 ROS-NFAT 信号和 PD-1 表达水平:STAT3 在 ILC3s 中对维持 RORγt 和 IL-22 表达至关重要。研究发现,LKB1 缺陷的 ILC3s 中磷酸化 STAT3(p-STAT3)水平降低。此外,LKB1 缺陷导致 ILC3s 中 ROS 产生增加、NFAT2 表达升高、PD-1+细胞比例显著增加,表明 LKB1 在 ILC3s 中抑制 ROS-NFAT 信号和 PD-1 表达。
讨论
组织驻留的 ILC3s 在黏膜免疫和组织稳态维持中起着关键作用。本研究表明,LKB1 对成年 ILC3 的维持和功能至关重要。LKB1 缺失导致 ILC3s 转录改变、生物能量学受损、线粒体功能障碍、ROS 产生增加,进而出现细胞死亡增加和 PD-1 高表达的耗竭表型。
LKB1 对不同免疫细胞的调控机制存在差异,在 ILC3s 中,MARK 信号通路在 LKB1 调节 ILC3 数量和 IL-22 产生中发挥重要作用。ILC3s 包含多个胎儿和成年细胞亚群,LKB1 对成年 ILC3 亚群数量有影响,但不影响胎儿 LTi 群体,这表明成年 ILC3s 和胎儿 LTi 细胞在代谢上可能存在差异,值得进一步研究。
Peutz-Jeghers 综合征由 LKB1 的生殖系突变引起,表现为胃肠道错构瘤性息肉病,Stk11突变还与炎症性肠病相关。鉴于 ILC3s 在调节肠道免疫和上皮稳态中的重要作用以及其对 LKB1 的依赖性,ILC3-LKB1 信号通路在这些疾病中的作用值得深入研究。
研究局限性
本研究虽利用小鼠模型揭示了 LKB1 对 ILC3s 的调控作用,但在人类 ILC3s 中 LKB1 的功能仍有待进一步研究,例如已知的 LKB1 突变如何影响人类 ILC3s。此外,本研究使用Rorc-cre 介导的 LKB1 敲除模型影响了 ILC3 在稳态下的生成和存活,未来需利用更多 ILC3 特异性 Cre 重组酶转基因工具,研究在感染和炎症扰动下 LKB1 缺失对 ILC3s 的影响。
资源可用性
如需进一步信息和请求,可联系通讯作者 Wendy S. Garrett(wgarrett@hsph.harvard.edu)。本研究未产生新的独特试剂,批量 RNA 测序数据已存入 NCBI BioProject 数据库,可公开获取,登录号在关键资源表和方法细节中列出。重新分析本文数据所需的其他信息可向通讯作者索取。
娑撳娴囩€瑰宓庢导锔炬暩鐎涙劒鍔熼妴濠団偓姘崇箖缂佸棜鍎禒锝堥樋閹活厾銇氶弬鎵畱閼筋垳澧块棃鍓佸仯閵嗗甯扮槐銏狀洤娴f洟鈧俺绻冩禒锝堥樋閸掑棙鐎芥穱鍐箻閹劎娈戦懡顖滃⒖閸欐垹骞囬惍鏃傗敀
10x Genomics閺傛澘鎼isium HD 瀵偓閸氼垰宕熺紒鍡氬劒閸掑棜椴搁悳鍥╂畱閸忋劏娴嗚ぐ鏇犵矋缁屾椽妫块崚鍡樼€介敍锟�
濞嗐垼绻嬫稉瀣祰Twist閵嗗﹣绗夐弬顓炲綁閸栨牜娈慍RISPR缁涙盯鈧鐗哥仦鈧妴瀣暩鐎涙劒鍔�
閸楁洜绮忛懗鐐寸ゴ鎼村繐鍙嗛梻銊ャ亣鐠佹彃鐖� - 濞e崬鍙嗘禍鍡毿掓禒搴n儑娑撯偓娑擃亜宕熺紒鍡氬劒鐎圭偤鐛欑拋鎹愵吀閸掔増鏆熼幑顔垮窛閹貉傜瑢閸欘垵顫嬮崠鏍掗弸锟�
娑撳娴囬妴濠勭矎閼崇偛鍞撮摂瀣鐠愩劋绨版担婊冨瀻閺嬫劖鏌熷▔鏇犳暩鐎涙劒鍔熼妴锟�