探究神经元中假尿苷（ψ）修饰动态：铅处理与细胞分化的影响

《Cell Systems》：Probing enzyme-dependent pseudouridylation using direct RNA sequencing to assess epitranscriptome plasticity in a neuronal cell line

研究人员对 SH-SY5Y 细胞进行研究，发现铅处理和分化影响 ψ 位点及相关酶，有助于探索其调控机制。

　　亮点：

• 假尿苷（ψ）在细胞状态变化时展现出可塑性。
• 铅处理比细胞分化揭示出更多占据率更低的 ψ 位点。
• 稳定位点与管家 mRNA 相关，可变位点反映外部信号。
• 研究结果揭示了 TRUB1 和 PUS7 酶在 ψ 动态变化中潜在的共调控关系。

摘要：mRNA 的化学修饰，如假尿苷（ψ），能够调控基因表达。然而，人们对其调控机制，尤其是在神经元中的调控机制知之甚少。研究人员应用纳米孔直接 RNA 测序技术，探究 SH-SY5Y 细胞中 ψ 的动态变化，该研究模拟了自然和非自然细胞状态下的两种干扰：维甲酸介导的细胞分化（健康状态）和暴露于神经毒性物质铅（不健康状态）。研究发现，部分 ψ 修饰酶的表达会随着生理条件发生显著变化。从整体来看，铅处理后的细胞比未处理细胞和分化细胞具有更多的 ψ 位点，但相对占据率更低。许多高度可变的 ψ 位点伴随着 ψ 修饰酶的稳定表达，这表明存在反式调控。在三种细胞状态下，许多 ψ 位点都保持稳定，这暗示其具有 “管家” 功能。这项研究有助于深入探究神经元中控制 ψ 修饰的机制，以及在细胞应激反应中其可能的保护作用。