编辑推荐：
为探究玉米籽粒含水量（GMC）和脱水速率（GDR）的遗传基础，研究人员构建图谱，发现相关 QTL 和候选基因，意义重大。
玉米，作为全球最重要的农作物之一，在农业生产中占据着举足轻重的地位。随着农业向全程机械化迈进，玉米生产的各个环节都面临着优化升级的需求。其中，玉米籽粒的脱水问题成为了关键焦点。高籽粒含水量（Grain Moisture Content，GMC）不仅会增加人工干燥、运输和储存的成本，还可能导致粮食在储存过程中因霉变而受损，给种植户带来巨大的经济损失。在一些低温、高湿且光照不足的地区，这个问题尤为突出。
为了深入了解 GMC 和籽粒脱水速率（Grain Dehydration Rate，GDR）的遗传基础，河南省农业科学院等机构的研究人员开展了一项极具意义的研究。该研究成果发表在《BMC Plant Biology》上，为玉米遗传育种和机械化生产提供了重要的理论依据和实践指导。
研究人员利用由 PB80 和 PHJ65 杂交产生的 310 个重组自交系（Recombinant Inbred Line，RIL）群体，通过单籽传法构建了实验材料。这些材料在河南的新乡、安阳和周口三个不同地理环境中种植，以涵盖不同的农业生态条件。研究采用了基因分型测序（Genotyping-by-sequencing，GBS）技术，构建了包含 5235 个 bin 标记、跨度为 1237.36 cM 的遗传连锁图谱。利用该图谱，研究人员在三个环境和不同发育阶段对 GMC 和 GDR 进行了数量性状位点（Quantitative Trait Loci，QTL）定位分析，并结合转录组分析确定了候选基因。
研究的主要技术方法包括：一是利用 GBS 技术进行高通量基因分型，获得高密度的单核苷酸多态性（Single Nucleotide Polymorphism，SNP）标记，为构建高精度的遗传图谱奠定基础；二是通过在多个环境下种植 RIL 群体，对 GMC 和 GDR 进行表型测定，获取丰富的表型数据；三是运用 QTL 定位软件和转录组分析技术，挖掘与 GMC 和 GDR 相关的 QTL 和候选基因。
研究结果如下：
- 构建高质量遗传图谱：利用 2,218,988 个高质量 SNP 标记，构建了包含 5235 个 bin 标记的遗传图谱。该图谱覆盖了 10 个连锁群，平均每个染色体上有 523 个 bin 标记，图谱密度为 4.23 bins/cM，相邻标记间平均遗传距离为 0.24 cM，物理距离为 402.25 kb。图谱的共线性良好，重组率计算准确，为后续的 QTL 定位提供了可靠的基础。
- 表型变异分析：RIL 群体在 GMC 和代表 GDR 的干旱曲线下面积（Area Under the Dry Down Curve，AUDDC）方面表现出超亲分离现象。随着籽粒发育，GMC 平均值从 31.84% 下降到 18.60%，变异系数（Coefficient of Variation，CV）从 6.25% 增加到 12.04%；AUDDC 平均值从 287.09 增加到 508.06，CV 从 6.49% 增加到 9.39%。方差分析表明，基因型、环境以及基因型与环境的交互作用对 GMC 和 AUDDC 均有显著影响，广义遗传力在 0.75 - 0.89（GMC）和 0.82 - 0.85（AUDDC）之间，说明这些性状受遗传和环境因素共同调控。
- QTL 定位：通过 QTL 定位分析，共鉴定出 23 个与 GMC 和 AUDDC 相关的 QTL，其中 9 个与 GMC 相关，分布在 1、2、5、6、9 和 10 号染色体上；14 个与 AUDDC 相关，分布在 1、2、3、4、5、6 和 10 号染色体上。单个 QTL 可解释 3.11% - 18.15% 的表型变异，部分 QTL 在多个环境和发育阶段稳定存在。例如，qGMC1.1 和 qGMC2.2 在所有环境和发育阶段均被检测到，分别可解释 5.80% - 13.66% 的 GMC 表型变异；qAUDDC2.2 在多个环境和发育阶段稳定存在，可解释 8.14% - 18.15% 的 AUDDC 表型变异。
- 转录组分析与候选基因预测：对亲本 PB80 和 PHJ65 在授粉后 35、45 和 55 天的籽粒进行转录组分析，发现二者存在显著的差异表达基因（Differentially Expressed Genes，DEGs）。在 PHJ65 中，45 和 55 天分别有 958 和 6,151 个基因上调表达。通过对 DEGs 的功能富集分析，发现其主要富集在代谢过程、氨基酸生物合成等功能类别。在 2 号染色体上，稳定的主要 QTL qGMC2.2 和 qAUDDC2.2 共定位在一个 81.6 kb 的区域，该区域内鉴定出 21 个候选基因，涉及转录因子、蛋白质相关基因、代谢过程相关基因等多个功能类别，其中 8 个基因在 PB80 和 PHJ65 之间存在显著差异表达，可能参与了蛋白质合成、代谢、昼夜节律调节和 DNA 转录等关键过程。
研究结论和讨论部分指出，该研究通过遗传优化 GMC 和 GDR，为推进机械化玉米收获提供了重要支持。稳定的 QTL 和候选基因的鉴定为标记辅助选择（Marker-assisted Selection，MAS）提供了潜在靶点，有助于培育更适合机械化收获的玉米品种。同时，研究揭示了 GMC 和 GDR 的复杂遗传结构，为进一步理解玉米籽粒脱水的分子机制奠定了基础。然而，这些位点在不同遗传背景和环境条件下的稳定性和有效性还需要进一步验证。未来的研究可以聚焦于对这些候选基因的功能验证，并将相关研究成果应用于实际育种工作中，从而提高玉米生产的效率和可持续性，为全球粮食安全做出贡献。
