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为探究 UCEC 潜在生物标志物,研究人员分析多数据库,发现 NR3C1 或可用于早期诊断及预后评估。
子宫内膜癌,作为女性生殖系统中常见的恶性肿瘤,近年来发病率呈上升趋势,如同隐藏在女性健康道路上的 “暗箭”,严重威胁着全球女性的生命健康。在中国,每 10 万人中就有 10.28 人发病,每 10 万人中有 1.9 人因此失去生命;而在欧美等发达国家,它更是稳坐妇科恶性肿瘤的 “头把交椅”。早期诊断和治疗对降低患者死亡率至关重要,但目前临床上仍缺乏有效的早期诊断标志物。因此,探寻子宫内膜癌潜在的生物标志物,成为了医学领域亟待攻克的难题。
在此背景下,解放军总医院第一医学中心妇产科等机构的研究人员,开展了一项针对子宫内膜癌的深入研究,相关成果发表在《Discover Oncology》杂志上。
研究人员为了深入剖析子宫内膜癌(Uterine corpus endometrial carcinoma,UCEC),运用了多种关键技术方法。首先,他们从 Gene Expression Omnibus(GEO)数据库筛选出 4 个 UCEC 相关数据集,利用 Pubmed GEO2R 分析工具,筛选出差异表达基因(Differentially expressed genes,DEGs) 。之后,借助 DAVID 在线数据库进行基因本体(Gene Ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)富集分析,探究 DEGs 的生物学功能。利用 STRING 在线数据库构建蛋白质 - 蛋白质相互作用(Protein–protein interaction,PPI)网络,筛选关键基因。并通过 Gene Expression Profiling Interactive Analysis(GEPIA)在线网站对关键基因进行验证,还运用 Cox 回归分析、ROC 曲线和 DCA 曲线分析等多种方法,评估关键基因对 UCEC 预后的影响 。
研究结果如下:
- 筛选出差异表达基因:通过对 4 个数据集分析,共鉴定出 5987(GSE17025)、244(GSE36389)、1491(GSE63678)和 483(GSE115810)个 DEGs,经 Venn 图分析,发现 72 个共表达基因。
- GO 和 KEGG 通路富集分析:KEGG 分析显示,这 72 个基因主要富集在癌症转录失调和白细胞跨内皮迁移等通路;GO 分析表明,其生物学过程主要涉及 RNA 聚合酶 II 启动子转录的负调控和正调控等。
- 构建 PPI 网络和筛选关键基因:构建 PPI 网络后,筛选出 NR3C1、SFRP4 等 10 个关键基因。
- 关键基因的验证:GEPIA 分析显示,NR3C1 在 UCEC 预后中表现出显著差异,且在 UCEC 组织中表达较低。
- ROC 和 DCA 曲线分析:多个数据集的 ROC 曲线显示,NR3C1 诊断 UCEC 的 AUC 值均超 0.78,DCA 曲线表明其净效益优于参考模型,意味着 NR3C1 有望成为 UCEC 诊断的潜在生物标志物。
- Cox 风险回归分析:Cox 分析表明,临床分期 III、IV 期、年龄和 NR3C1 是影响 UCEC 预后的独立因素。
- NR3C1 表达与肿瘤浸润免疫细胞的相关性分析:研究发现,NR3C1 表达与 11 种免疫细胞含量有关,如与 na?ve B 细胞、M1 等呈正相关,与 M0、激活的肥大细胞等呈负相关。这揭示了 NR3C1 表达与 UCEC 免疫微环境的复杂关系。
- NR3C1 的蛋白质表达水平分析:通过 HPA 数据库分析,发现 NR3C1 表达增加与 UCEC 疾病状态恶化相关,进一步凸显其预后价值。
- NR3C1 共表达基因分析:LinkedOmics 数据库分析确定了 50 个与 NR3C1 共表达的基因,包括正相关和负相关基因,有助于深入理解其分子调控网络。
- 基因集富集分析:GSEA 分析显示,NR3C1 高表达表型在核糖体、氧化磷酸化等 KEGG 通路以及抗原受体介导的信号通路等 GO 项目中显著富集。
研究结论和讨论部分指出,NR3C1 在 UCEC 的发生、发展和预后中起着关键作用。它不仅可能是 UCEC 早期诊断的生物标志物,还与患者的生存结局密切相关。其表达水平的变化影响着肿瘤微环境中免疫细胞的浸润,有望作为预测患者对免疫检查点抑制剂治疗反应的指标。然而,该研究存在一定局限性,如缺乏临床实验验证、样本选择可能存在偏差等。未来还需进一步开展临床研究,扩大样本量,整合临床数据与生物信息学分析结果,并进行体外和体内实验,以充分验证 NR3C1 的临床价值。但不可否认的是,这项研究为 UCEC 的诊疗开辟了新方向,为后续研究奠定了坚实基础,有望推动 UCEC 个性化治疗策略的发展,为广大患者带来新的希望。