《Journal of Virology 4.0》:The GP2a 91/97/98 amino acid substitutions play critical roles in determining PRRSV tropism and infectivity but do not affect immune responses
### 猪繁殖与呼吸综合征病毒研究进展:GP2a 氨基酸替换的关键作用及疫苗开发意义
猪繁殖与呼吸综合征(Porcine reproductive and respiratory syndrome,PRRS)是全球养猪业中极具经济影响力的传染病,每年给全球养猪产业造成约 27 亿美元的损失。该疾病由猪繁殖与呼吸综合征病毒(Porcine reproductive and respiratory syndrome virus,PRRSV)引起,可导致母猪繁殖障碍和各年龄段猪的呼吸窘迫综合征。PRRSV 是一种包膜单链正链 RNA 病毒,基因组约 15kb,包含至少 10 个开放阅读框(Open Reading Frames,ORFs),编码多种结构和非结构蛋白。目前,PRRSV 分为
PRRSV -1 和 PRRSV-2 两个种,在中国,PRRSV-2 分离株是猪群中的主要流行毒株 。
尽管 PRRSV 分离株遗传多样性高,但它们的宿主和细胞嗜性较为局限。猪是 PRRSV 的唯一自然宿主,在体内,只有巨噬细胞和单核细胞谱系的特定细胞对 PRRSV 易感;在体外,MA104、CL2621 和 Marc-145 等细胞可用于 PRRSV 的增殖。其中,Marc-145 细胞是 PRRSV 分离和疫苗开发中最常用的细胞系,但越来越多的 PRRSV 分离株无法感染 Marc-145 细胞,确定 PRRSV 对 Marc-145 细胞嗜性的关键决定因素对疫苗开发具有重要意义 。
在本研究中,科研人员通过构建基于 NADC34-like PRRSV-2、NADC30-like PRRSV-2、HP-PRRSV-2 和 PRRSV-1 感染性克隆的嵌合病毒,探索了 PRRSV 对 Marc-145 细胞嗜性的关键决定因素。研究结果为 PRRSV 嗜性和感染性提供了新的见解,对 PRRS 疫苗开发也具有重要的指导意义 。
1. 目前流行的 PRRSV 分离株表现出不同的 Marc-145 细胞嗜性
研究人员首先测定了当前流行的 PRRSV-2 分离株(NADC34-like BJ1805-2 株、NADC30-like SD17-38 株和 HP-PRRSV-2 XJ17-5 株)的体外细胞嗜性。结果发现,猪肺泡巨噬细胞(Porcine alveolar macrophages,PAMs)对这些分离株均易感,但产生的病毒滴度不同,其中 NADC34-like BJ1805-2 在 PAMs 中的复制效率最高。而 Marc-145 细胞仅对 XJ17-5 分离株易感,对 SD17-38 和 BJ1805-2 菌株不敏感。通过蛋白质免疫印迹(Western Blot,WB)、免疫荧光分析(Immunofluorescence Assay,IFA)、细胞病变效应(Cytopathic effect,CPE)观察和噬斑检测等实验,进一步证实了 HP-PRRSV-2 XJ17-5 分离株具有 Marc-145 细胞适应性,而 NADC34-like BJ1805-2 和 NADC30-like SD17-38 菌株则不具有 。
2. GP2a 中 91/97/98 位氨基酸替换是 NADC34-like 和 NADC30-like PRRSV-2 适应 Marc-145 细胞的充分必要决定因素
为探究 PRRSV 对 Marc-145 细胞嗜性的关键决定因素,研究人员构建了 NADC34-like PRRSV-2 BJ1805-2 和 HP-PRRSV-2 XJ17-5 的感染性克隆(rBJ1805-2 和 rXJ17-5)。先前研究表明,ORFs 2 - 4 基因编码的次要包膜蛋白是 PRRSV 嗜性的主要决定因素,因此研究人员构建了交换 rXJ17-5 和 rBJ1805-2 感染性克隆中 ORFs 2 - 4 基因的嵌合病毒。IFA 结果显示,含有 rXJ17-5 的 ORFs 2 - 4 的嵌合 rBJ1805-2 病毒(rBTX234)获得了 Marc-145 细胞适应性,而含有 rBJ1805-2 的 ORFs 2 - 4 的嵌合 rXJ17-5 病毒(rXTB234)则失去了 Marc-145 细胞适应性,证实了次要包膜蛋白是 NADC34-like rBJ1805-2 菌株 Marc-145 细胞嗜性的决定因素 。
随后,研究人员构建了一系列含有 rXJ17-5 中一个或两个次要包膜蛋白编码基因的嵌合 rBJ1805-2 病毒,发现含有 rXJ17-5 的 ORF2 基因的三个嵌合病毒(rBTX2、rBTX23 和 rBTX24)获得了 Marc-145 细胞适应性,表明 ORF2 基因编码的 GP2a 是 rBJ1805-2 病毒 Marc-145 细胞适应性的关键决定因素。进一步构建含有片段替换的嵌合病毒,确定了 GP2a 89 - 98 位氨基酸是决定区域,该区域存在 91/97/98 位氨基酸的三个保守替换。将 rBJ1805-2 病毒中 GP2a 91/97/98 位氨基酸的 “TMF” 模式替换为 “VVL” 模式后,病毒(rBJ-VVL)获得了 Marc-145 细胞嗜性,且将含有 “VVL” 模式的 Marc-145 适应性嵌合病毒中这三个氨基酸突变回 “TMF” 模式后,病毒失去了 Marc-145 细胞适应性,表明 GP2a 91/97/98 位氨基酸替换是 NADC34-like PRRSV-2 rBJ1805-2 菌株 Marc-145 细胞适应性的充分必要决定因素 。
由于 NADC34-like PRRSV-2 和 NADC30-like PRRSV-2 都属于谱系 1 PRRSV-2,研究人员进一步评估了 GP2a 91/97/98 位氨基酸模式对 NADC30-like rSD17-38 感染性克隆 Marc-145 细胞适应性的影响。结果表明,含有 rXJ17-5 的 ORFs 2 - 4 的嵌合 rSD17-38 病毒(rSTX234)和仅含有 GP2a 91/97/98 “VVL” 替换的突变 rSD17-38 病毒(rSD-VVL)都获得了 Marc-145 细胞适应性,且含有两个替换的突变病毒不能感染 Marc-145 细胞,将 rSTX234 中 GP2a 91/97/98 位氨基酸突变回 “TMF” 模式后,病毒失去了 Marc-145 细胞嗜性,说明 GP2a 91/97/98 位氨基酸替换也是 NADC30-like rSD17-38 菌株 Marc-145 细胞嗜性的充分必要决定因素 。
3. GP2a 中 91/97/98 位氨基酸替换是 HP-PRRSV-2 适应 Marc-145 细胞的充分但非必要决定因素
虽然含有 rBJ1805-2 的 ORFs 2 - 4 的嵌合 HP-PRRSV-2 rXJ17-5(rXTB234)失去了 Marc-145 细胞适应性,但当将 GP2a 91/97/98 位氨基酸替换恢复为 “VVL” 时,突变的嵌合病毒(rXTB234-VVL)又获得了 Marc-145 细胞适应性,说明 GP2a 91/97/98 位氨基酸替换是 HP-PRRSV-2 rXJ17-5 菌株 Marc-145 细胞适应性的充分决定因素。然而,仅含有 “TMF” 模式的突变 rXJ17-5 菌株(rXJ-TMF)仍然保持 Marc-145 细胞嗜性,表明该氨基酸替换不是 HP-PRRSV-2 Marc-145 细胞适应性的必要决定因素 。
除次要包膜蛋白外,主要包膜蛋白(GP5 和 M)和 nsp2 也被报道与 PRRSV 嗜性有关。研究人员评估了它们对 HP-PRRSV-2 Marc-145 细胞嗜性的影响,发现含有 Marc-145 非适应性菌株(rBJ1805-2)的 GP5 和 M 编码基因的嵌合病毒(rXTB-TMF-56)仍能感染 Marc-145 细胞,说明主要包膜蛋白对 Marc-145 细胞适应性不是关键因素;而含有 rBJ1805-2 的 nsp2 编码基因的嵌合病毒(rXTB-TMF-nsp2)无法拯救 。
基于含有 GP2a 91/97/98 “TMF” 模式的突变 rXJ17-5 菌株(rXJ-TMF),研究人员构建了一系列嵌合病毒来寻找 HP-PRRSV-2 中 Marc-145 细胞适应性的其他充分决定因素。结果发现,GP2a-GP3(不包括 GP2a 91/97/98 位氨基酸替换和 GP3-GP4 重叠区域)和 GP3-GP4 区域是 HP-PRRSV-2 中 Marc-145 细胞适应性的另外两个充分决定因素 。
4. GP2a 中 91/97/98 位氨基酸替换是 PRRSV-1 适应 Marc-145 细胞的必要但非充分决定因素
PRRSV-2 中 GP2a 91/97/98 位氨基酸在 PRRSV-1 中的对应位置是 GP2a 88/94/95 位氨基酸,已有研究表明它们与 PRRSV-1 在 Marc-145 细胞中的适应性有关。为验证这些氨基酸替换是否是转换 Marc-145 细胞适应性的充分决定因素,研究人员在 Marc-145 非适应性 PRRSV-1 菌株(rHLJB1)中进行了评估。研究人员将 rHLJB1 菌株中的 ORF2 - ORF3 基因(包括 ORF3 - ORF4 重叠区域)替换为 Amervac 疫苗株的相应基因,构建了嵌合病毒 rHTA23,发现 rHTA23 获得了 Marc-145 细胞嗜性。但将 rHLJB1 中 GP2a 的 “IMF” 模式突变为 “FIL” 模式后生成的 rHLJB1-FIL 并未获得 Marc-145 细胞适应性,表明 PRRSV-1 中 GP2a 的三重氨基酸替换不是 Marc-145 细胞适应性的充分决定因素 。
研究人员进一步构建了另外两个含有 Amervac 株 ORF2 和 ORF3 的嵌合 rHLJB1 病毒(rHTA2 和 rHTA3),它们均不能适应 Marc-145 细胞。而含有 GP2a “FIL” 模式和 Amervac 株 GP3 的嵌合病毒(rHTA-FIL-3)获得了 Marc-145 细胞嗜性。继续构建含有 GP2a “FIL” 模式和 Amervac 株 GP3 不同片段的嵌合病毒,发现 rHTA-FIL-3–182-270aa 病毒获得了 Marc-145 细胞适应性,而 rHTA-FIL-3-1-181aa 则没有,表明 GP2a 三重氨基酸替换与 GP3-GP4 重叠区域结合是 PRRSV-1 中 Marc-145 细胞嗜性的充分决定因素 。
5. PRRSV-1 和 PRRSV-2 之间 GP2a 91/97/98 位氨基酸替换对 Marc-145 细胞适应性的影响
研究人员基于两个 Marc-145 非适应性 PRRSV-2 感染性克隆(rBJ1805-2 和 rSD17-38),构建了含有 Marc-145 适应性 PRRSV-1 株(Amervac)GP2a “FIL” 模式的突变病毒(rBJ-FIL 和 rSD-FIL),发现这两个突变病毒都获得了 Marc-145 细胞嗜性,表明来自 Marc-145 适应性 PRRSV-1 株的 GP2a 三重氨基酸替换足以转换谱系 1 PRRSV-2 分离株的 Marc-145 细胞嗜性 。
相反,构建的含有 Marc-145 适应性 PRRSV-2 株(rXJ17-5)GP2a 91/97/98 “VVL” 模式的突变 PRRSV-1 株(rHLJB1-VVL)仍然不能感染 Marc-145 细胞。由于 PRRSV-1 和 PRRSV-2 中 GP3-GP4 重叠区域大小不一致,研究人员未进一步构建含有 PRRSV-2 的 GP2a “VVL” 替换和 GP3-GP4 重叠区域的嵌合 PRRSV-1 病毒。这些结果与上述发现一致,即 GP2a 三重氨基酸替换是谱系 1 PRRSV-2 分离株 Marc-145 细胞适应性的充分决定因素,但不是 PRRSV-1 菌株的充分决定因素 。
6. PRRSV 分离株中 GP2a 91/97/98 位氨基酸模式高度多样
考虑到 GP2a 91/97/98 位氨基酸模式对 PRRSV 嗜性的关键影响,研究人员通过生物信息学分析评估了 PRRSV-1 和 PRRSV-2 中这些氨基酸的遗传多样性。结果发现,GP2a 91/97/98 位氨基酸模式在 PRRSV-1 和 PRRSV-2 中都高度多样,“FMF”、“VMF” 和 “IMF” 是 PRRSV-1 中的三种主要模式,“VVL”、“TMF” 和 “TML” 是 PRRSV-2 中的三种主要模式 。
回顾性分析发现,具有 GP2a “FIL” 模式的 PRRSV-1 GZ11-G1 和 Amervac 菌株是 Marc-145 适应性的,而具有 “IM/TMF” 模式的 HLJB-1 和 BJEU06-1 分离株是非适应性的;具有 GP2a “VVL” 模式的 NADC30-like 重组体和 HP-PRRSV-2 分离株是 Marc-145 适应性的,而具有 “TMF” 模式的谱系 1 PRRSV-2 分离株是非适应性的,这些结果与本研究中嵌合病毒的结果一致 。
7. GP2a 91/97/98 位氨基酸替换也影响 PRRSV 对 PAMs 的感染性
Marc-145 非适应性的 BJ1805-2 分离株在 PAMs 中的复制效率明显高于 Marc-145 适应性的 XJ17-5 分离株。为分析 GP2a 91/97/98 位氨基酸替换是否在 PRRSV 对 PAMs 的感染性中起作用,研究人员比较了亲本 rBJ1805-2 和两个突变病毒(rBJ-VVL 和 rBJ-FIL)在 PAMs 中的复制效率。WB 结果显示,rBJ1805-2 感染的 PAMs 中检测到的 N 蛋白量高于 rBJ-VVL 和 rBJ-FIL 感染的 PAMs;IFA 检测也表明,突变病毒的感染效率明显低于亲本病毒和反向突变病毒,验证了 GP2a 91/97/98 位氨基酸替换影响 PRRSV 对 PAMs 的感染性 。
8. GP2a 91/97/98 位氨基酸替换影响 PRRSV 在仔猪中的感染性,但不影响免疫反应
为进一步研究 GP2a 91/97/98 位氨基酸替换对 PRRSV 体内感染性的影响,研究人员进行了仔猪接种实验。将 20 只 4 周龄 PRRSV 阴性健康仔猪分为四组,两组分别接种 rBJ1805-2 和 rBJ-VVL,另外两组接种 DMEM 作为阴性对照。结果发现,rBJ1805-2 感染的仔猪在 7 - 10 天出现发热,rBJ-VVL 感染的仔猪未出现发热,且 rBJ1805-2 感染仔猪的病毒血症在 5 - 14 天明显高于 rBJ-VVL 感染仔猪,表明 GP2a 91/97/98 位氨基酸替换影响 NADC34-like PRRSV-2 在仔猪中的感染性 。
在 43 天,对部分仔猪用另一种 NADC34-like SDLY23-1742 分离株进行攻毒实验。结果显示,rBJ1805-2 和 rBJ-VVL 接种的仔猪在攻毒后病毒血症、肺部病毒载量和病理损伤均明显低于 SDLY23-1742 攻毒的仔猪,且两者提供的保护水平相似。检测体液免疫反应发现,rBJ1805-2 和 rBJ-VVL 诱导的中和抗体(neutralizing antibodies,nAbs)水平、T 滤泡辅助细胞(T follicular helper cells,Tfh)百分比在两组之间无显著差异;检测细胞免疫反应发现,两组诱导的 PRRSV 特异性 IFN-γ 分泌细胞(IFN-γ-SC)水平也无显著差异,表明 GP2a 91/97/98 位氨基酸替换不显著影响免疫反应 。
9. 讨论
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