空间转录组学揭示心脏型与经典型坏死性小肠结肠炎肠道表型的潜在差异

【字体: 时间:2025年03月20日 来源:iScience 4.6

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  为探究心脏型和经典型坏死性小肠结肠炎(NEC)的差异,研究人员对比分析其回肠空间转录组,发现两者在细胞组成、代谢及免疫等方面存在差异,为后续研究提供方向。

  坏死性小肠结肠炎(Necrotizing enterocolitis,NEC)是新生儿重症监护病房中常见且严重的胃肠道疾病,如同隐藏在新生宝宝身体里的 “恶魔”,时刻威胁着他们的生命健康。极低出生体重(VLBW,<1500g)婴儿中约 7%、极极低出生体重(ELBW,<1000g)婴儿中约 10% 会受到它的侵害,死亡率在 VLBW 婴儿中更是接近 30%。NEC 的病因复杂,目前尚未完全明确,普遍认为是多种因素共同作用的结果,比如早产导致的免疫系统不成熟、肠道发育不完善,以及肠道菌群失调等。
在 NEC 的 “大家族” 里,有两种主要类型备受关注,即经典型 NEC 和心脏型 NEC。经典型 NEC 主要与早产相关,而心脏型 NEC 则常出现在患有先天性心脏病(CHD)的婴儿身上。虽然这两种类型的 NEC 在症状上有相似之处,都会出现喂养不耐受、腹胀等情况,但它们在发病机制、临床特征等方面却可能存在差异。以往的研究虽然对经典型 NEC 有了一定的了解,但由于心脏型 NEC 病例相对较少,针对它的研究还很不足,许多问题仍停留在猜测阶段。

为了深入了解这两种 NEC 的差异,来自美国俄克拉荷马大学健康科学中心(University of Oklahoma Health Sciences Center)等机构的研究人员开展了一项重要研究。他们的研究成果发表在《iScience》杂志上,为我们认识这两种疾病打开了新的窗口。

研究人员主要采用了空间转录组学技术,这一技术就像是给研究人员提供了一双 “微观透视眼”,能够帮助他们在保留组织空间结构的同时,分析不同细胞类型的基因表达情况。研究样本来自接受肠道切除术的心脏型 NEC(n = 2)和经典型 NEC(n = 5)患者的回肠组织。

在研究过程中,研究人员利用 NanoString GeoMx 数字空间分析(DSP)技术对回肠组织特定区域的转录组进行测序。通过对这些数据的分析,他们发现心脏型和经典型 NEC 在转录水平上存在明显差异。即使在疾病晚期,这两种类型 NEC 的上皮细胞和免疫细胞在转录层面也截然不同。具体来看,在细胞类型差异方面,心脏型 NEC 的回肠区域富含 B 细胞(如前 B 细胞)和间充质细胞(如滤泡树突状细胞等),而一些上皮细胞(如表达 CA2、SLC26A2和 FABP1的细胞)则相对减少。同时,心脏型 NEC 的免疫细胞相关基因表达特征与 DNA 损伤反应、TGF-β 信号通路激活等有关,而经典型 NEC 的免疫细胞则更多地表现出 T 细胞炎症编程和趋化等特征。

在信号通路差异上,研究发现多巴胺能和血管内皮生长因子(VEGF)信号通路在两种 NEC 的免疫细胞转录差异中起着重要作用。经典型 NEC 的免疫细胞在多巴胺和 G 蛋白偶联受体(GPCR)信号通路中表现出富集,其中 HOXB7等基因的表达与 VEGF 表达相关。相比之下,心脏型 NEC 的 VEGF 和多巴胺 D2受体(D2R)信号相对缺乏。对于经典型 NEC 的上皮细胞,其特征表现为病原体诱导的细胞因子风暴信号,涉及免疫趋化、免疫球蛋白 A(IgA)产生等过程。而心脏型 NEC 的上皮细胞则更多地与线粒体功能和细胞凋亡调节相关。

进一步分析发现,两种 NEC 在对内质网应激和粘膜酸中毒的反应上也存在差异。经典型 NEC 的转录特征体现为粘膜酸中毒,伴随着中性粒细胞迁移和激活;而心脏型 NEC 则表现为对内质网应激的功能失调反应,这与细胞凋亡、屏障功能降低和病原体清除减少有关。在基因相互作用方面,病原体诱导的细胞因子风暴信号在经典型 NEC 中更为显著,同时经典型 NEC 还涉及更多与肠道神经功能和体重调节相关的基因;而心脏型 NEC 则有更多与内皮迁移和血管生成相关的基因下调。

综合来看,这项研究通过空间转录组学技术揭示了心脏型和经典型 NEC 在肠道上皮和免疫细胞方面的差异。研究结果表明,经典型 NEC 可能由菌群失调引发,伴随着细胞因子风暴和粘膜酸中毒;而心脏型 NEC 则与 VEGF 诱导的血管生成减少和内质网应激增强有关。这些发现为深入理解两种 NEC 的发病机制提供了重要依据,有助于未来开发更有针对性的治疗方法。同时,研究也存在一定的局限性,比如样本量较小、转录组与蛋白质组的相关性有待进一步研究等,但这并不影响其在 NEC 研究领域的重要意义,为后续研究指明了方向,有望推动该领域的进一步发展。
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