探秘尼日利亚牛种 IRF3 基因:遗传多样性与抗病潜力的关键线索
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时间:2025年03月20日
来源:Tropical Animal Health and Production 1.7
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研究人员对尼日利亚牛种的 IRF3 基因进行遗传特征分析,发现其多态性丰富且种群间变异大。
干扰素调节因子 3(IRF3)是与众多健康相关表型(如一般抗病性)密切相关的关键候选基因。研究旨在对尼日利亚的恩达马牛(N’Dama)、穆图鲁牛(Muturu)和白富拉尼牛(White Fulani)的 IRF3 基因进行遗传特征分析。研究人员利用 Zymo - spin 提取试剂盒从血液样本中提取 DNA,借助 ARLEQUIN 2.0001 软件估算基础群体遗传统计数据,使用 DnaSP 5.10.01 版本软件评估遗传多样性指数并检测是否偏离中性。经聚合酶链式反应和测序后,利用密码子比对软件在三个牛种的 IRF3 基因的 1 - 2 号外显子和 5 - 6 号外显子中分别发现了 18 个和 29 个单核苷酸多态性(SNPs)。在 1 - 2 号外显子中,穆图鲁牛(MU)的 SNPs 数量(16 个)和遗传多样性指数最高,恩达马牛(ND)最少(1 个)。在 5 - 6 号外显子中,白富拉尼牛的 SNPs 数量最多(14 个),遗传多样性指数也较高,而穆图鲁牛最少。针对所研究位点进行的分子变异分析(AMOVA)显示,种群间的变异水平高于种群内。因此得出结论,IRF3 基因在尼日利亚牛种中存在大量多态性,且具有高度多样性。
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