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本文综述了适体、SELEX 技术,探讨其应用、局限及未来方向,助力该领域研究。
引言
适体(Aptamers),作为单链核酸分子,又被形象地称为 “化学抗体”。它能以非凡的亲和力和选择性,精准地与各类目标分子结合。在许多应用场景中,尽管抗体一直以来被视为理想之选,但适体凭借其独特的优势,逐渐崭露头角。其优势包括尺寸小巧、成本低廉、合成过程统一规范、可根据需求进行定制化修饰,并且具备核酸模板特性。
上世纪 90 年代初,Ellington、Szostak 以及 Tuerk、Gold 这两个研究团队,分别成功分离出能够特异性结合不同目标分子的 RNA 序列,为适体的发展拉开了序幕。而指数富集配体系统进化技术(Systematic Evolution of Ligands by Exponential Enrichment,SELEX),则是一种强大的体外筛选方法,能够从由约 1015 种不同序列组成的庞大核酸库中,筛选出所需的适体。
适体在诊断领域展现出巨大的潜力,它可以与功能基团、药物或纳米颗粒进行化学修饰。令人欣喜的是,新的研究发现适体在检测和中和细菌方面效果显著,为抗击传染病开辟了新的道路。此外,适体还被用于开发创新的生物传感器,实现疾病的早期检测,推动了精准医学的发展。纳米材料与适体的结合,更是进一步提升了适体在医学领域的应用潜力。例如,在癌症治疗中,适体能够将化疗药物直接输送到肿瘤细胞,在发挥治疗作用的同时,最大程度减少对全身的损害。与抗体相比,适体寡核苷酸的微小尺寸使其更容易进入肿瘤细胞。在检测、成像以及靶向药物递送等应用中,适体还可以与非编码 RNA、药物、蛋白质和纳米颗粒等进行偶联。目前,适体作为生物材料,在生物传感探针、诊断和治疗工具、新药研发以及药物递送系统等多个研究方向上广泛应用。针对与多种疾病相关的特定靶点,如病毒感染和癌症,研究人员也在积极探索相关适体。2004 年,美国食品药品监督管理局(FDA)批准了针对血管内皮生长因子的适体 Macugen,用于治疗新生血管性年龄相关性黄斑变性,这成为适体应用发展历程中的一个重要里程碑。
SELEX(指数富集配体系统进化技术)
SELEX 是一种用于筛选适体的关键技术,这些适体是能够特异性结合目标分子的短核酸序列。整个筛选过程包含一系列循环步骤,主要有结合、清洗、纯化和扩增,通过这些步骤不断富集对目标分子具有高亲和力的核酸。
筛选首先要进行孵育,将目标分子与一个包含大量适体的核酸文库共同孵育。这个文库中的适体数量庞大,每个适体都有其独特的序列,它们就像一把把形状各异的 “钥匙”,试图找到与之匹配的 “锁”—— 目标分子。在孵育过程中,适体与目标分子相互作用,尝试结合。孵育结束后,需要对结合了目标分子的适体进行清洗,去除那些没有结合或者结合不紧密的核酸分子。这一步就像是一场 “淘汰赛”,只有与目标分子紧密结合的适体才能留下来。清洗过后,通过纯化技术,将结合了目标分子的适体从混合物中分离出来,得到纯度较高的适体样本。最后一步是扩增,利用 PCR(聚合酶链式反应)等技术,对筛选得到的适体进行扩增,增加其数量,以便进行下一轮筛选。通过多轮这样的循环,能够逐步富集对目标分子具有高亲和力和特异性的适体。
适体技术中的化学修饰和功能增强
适体作为一种小型单链核酸,拥有独特的三维结构,这一结构赋予了它与目标分子高亲和力结合的能力。在适体技术的发展过程中,研究人员发现了许多适合体外筛选方法酶促阶段的核苷酸修饰方式。这些修饰就像是给适体穿上了 “特殊装备”,能够显著提高核酸文库的化学多样性和生物学特性。经过修饰后,适体对核酸酶的稳定性得到增强,就像给适体披上了一层 “防护铠甲”,使其在体内复杂的环境中更不容易被核酸酶降解;同时,适体进入细胞的能力也得到提升,这有助于适体更好地发挥其功能,例如在细胞内实现对特定分子的检测或靶向治疗。
适体的应用
适体在疾病的治疗、诊断和预后评估等方面取得了显著的进展。
在治疗领域,适体可以作为药物载体,将治疗药物精准地输送到病变细胞。以癌症治疗为例,通过将化疗药物与适体偶联,适体能够利用其对肿瘤细胞表面特定分子的识别能力,将药物直接运送到肿瘤细胞内部,提高药物在肿瘤部位的浓度,增强治疗效果,同时减少对正常细胞的损伤,降低药物的副作用。在心血管疾病治疗中,适体也展现出一定的潜力,它可以通过靶向特定的细胞或分子,调节相关的生理过程,达到治疗疾病的目的。
在诊断方面,适体凭借其高特异性和高亲和力的结合特性,成为生物传感器的理想组成部分。基于适体的生物传感器能够快速、灵敏地检测生物标志物。例如,在检测新冠病毒时,利用与新冠病毒特定蛋白具有高亲和力的适体构建生物传感器,能够在短时间内检测出样本中是否存在病毒,为疫情防控提供了有力的工具。在肿瘤诊断中,通过检测血液或其他生物样本中的肿瘤标志物,基于适体的传感器可以实现肿瘤的早期发现,提高患者的治愈率。
在预后评估方面,适体可以帮助医生了解疾病的发展进程和治疗效果。通过监测特定适体与相关分子的结合情况,医生可以判断疾病是否得到有效控制,以及患者的康复情况,为后续的治疗方案调整提供依据。
临床试验
目前,多种适体正在进行临床试验,用于诊断或治疗各种疾病。在肿瘤领域,针对不同类型肿瘤的适体药物正在进行临床试验评估。例如,某些适体药物旨在通过靶向肿瘤细胞表面的特定受体,抑制肿瘤细胞的生长和扩散。在眼科疾病方面,除了前面提到的 Macugen 用于治疗年龄相关性黄斑变性外,还有其他适体药物正在研究用于治疗青光眼、视网膜病变等疾病。在感染性疾病方面,适体也被用于开发新型诊断试剂和治疗药物,如针对流感病毒、艾滋病病毒等病原体的适体正在临床试验中接受检验,评估其在疾病诊断和治疗中的有效性和安全性。
专利
关于适体的专利众多,涵盖了适体的筛选方法、修饰技术、应用领域等多个方面。一些专利聚焦于改进 SELEX 技术,提高适体筛选的效率和特异性;有的专利则关注适体的化学修饰方法,通过独特的修饰策略提升适体的性能;还有大量专利围绕适体在生物传感器、药物递送系统、疾病诊断和治疗等应用方面展开,保护了相关的创新成果,推动了适体技术的商业化发展。
适体的局限性
尽管适体在诊疗应用方面前景广阔,但在发展过程中仍面临诸多挑战。其中一个关键限制在于目标选择。适体有时会出现交叉反应,即它不仅会与预期的目标分子结合,还可能与结构相似的其他分子结合,从而产生脱靶效应。这种情况就好比一把 “钥匙” 开错了 “锁”,可能会引发一系列不良后果。为了解决这个问题,研究人员在 SELEX 筛选过程中采用了负筛选策略,使用结构相关的分子来排除那些容易产生交叉反应的适体。
此外,传统的基于蛋白质的 SELEX 技术存在一定的局限性,它并不适用于未知的、不溶性的或者难以纯化的目标分子。对于这些特殊的目标分子,传统的 SELEX 技术就像遇到了 “难题”,无法有效地筛选出与之特异性结合的适体,这在一定程度上限制了适体在某些领域的应用和发展。
未来展望
适体技术目前仍处于发展的初期阶段,如同一个刚刚起步的 “幼苗”,需要进一步的培育和发展,才能实现更广泛的应用。在适体药物的持续研发过程中,需要在适体设计和优化方面取得更多的创新和突破。
研究人员期望通过发现新的化学修饰方法、构建多样化的结构以及开发新的偶联策略,进一步提高适体的结合亲和力、稳定性和药代动力学特性。这些改进有望重新定义适体在生物医学领域的应用边界,为疾病的诊断、治疗和预防带来更多的可能性。例如,新的化学修饰可能使适体在体内的稳定性大幅提升,延长其作用时间;多样化的结构设计或许能让适体识别更多种类的目标分子,拓宽其应用范围;新的偶联策略则可能实现更高效的药物递送,提高治疗效果。随着技术的不断进步,适体有望在未来的医学领域发挥更为重要的作用,为人类健康带来更多福祉。
结论
在过去的三十年里,适体的研究领域不断拓展,从最初针对小分子和可溶性蛋白质分子,逐渐延伸到细胞表面受体以及器官等层面。随着诊疗技术和核酸工程的不断发展,核苷酸适体的研究和应用取得了显著进展。这些基于单链 RNA 和 DNA 寡核苷酸的小型核酸配体,能够以极高的特异性和亲和力与目标分子结合。它们具有良好的亲和力、较低的免疫原性,并且能够通过化学合成制备,为生物医学领域的研究和应用提供了一种极具潜力的工具。在未来,随着技术的进一步完善和突破,适体有望在疾病的诊断、治疗以及预防等方面发挥更为重要的作用,为人类健康事业做出更大的贡献。
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