Arisaema takesimense叶绿体基因组研究：解锁物种鉴定与多样性评估新密码

研究人员解析A. takesimense叶绿体 (cp.) 基因组，发现关键区域和关系，助力物种鉴定与多样性评估。

　　Arisaema takesimense（天南星科）是韩国郁陵岛特有的物种。本研究展示了A. takesimense完整的叶绿体（cp.）基因组，其由 174,361 个碱基对组成，呈现典型的四分体结构。该基因组编码 112 个独特基因，包括 78 个蛋白质编码基因（CDS）、30 个 tRNA 基因和 4 个 rRNA 基因。在本研究中，共鉴定出 49 个长重复序列和 139 个简单序列重复（SSR），这些重复序列主要位于基因间隔区（IGS）。此外，还识别出几个热点区域，包括trnS-G、accD-psaI、ndhF 和rps15-ycf1，这些区域在天南星科物种中普遍存在。对这些重复序列的分析揭示了物种特异性的 SSR 类型和热点区域，可用于群体遗传学研究和物种鉴定。对 11 个天南星属分类群的比较基因组分析表明，大单拷贝区域（LSC）的变异性最大，非编码基因的变异比编码基因更多。天南星属分类群中 LSC - IR - SSC 区域之间的边界通常保存良好，但A. takesimense、A. ringens和A. nepenthoides的 LSC/IR_a、LSC/IR_b和 SSC/IR_b连接位置存在明显差异。基于 cp. 基因组的系统发育分析显示，A. takesimense与A. bockii关系密切。本研究成果大幅增加了天南星科可用的基因组资源，为物种鉴定和评估天南星属内的种内多样性提供了宝贵资源。