缺血性脑卒中焦亡相关基因的新发现:为治疗带来新希望

【字体: 时间:2025年03月17日 来源:BMC Medical Genomics 2.1

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  为探究缺血性脑卒中(IS)的潜在干预靶点,研究人员筛选出与脑缺血再灌注损伤(CIRI)和焦亡相关的枢纽基因,为 IS 治疗提供新方向。

  # 缺血性脑卒中焦亡相关基因研究成果解读
在人体的 “生命之河”—— 脑血管中,一旦出现 “堵塞”,就可能引发严重的健康危机。缺血性脑卒中(IS)就是这样一种极为凶险的疾病,它如同潜伏在身体里的 “定时炸弹”,全球范围内,其高致死率和高致残率严重威胁着人们的生命健康。目前,针对 IS 的治疗手段十分有限,即使采用恢复缺血区域血液灌注的方法,如药物溶栓或机械溶栓,也会面临再灌注损伤的难题,也就是脑缺血再灌注损伤(CIRI)。这就好比在疏通河道的过程中,反而对河岸造成了更大的破坏,使得患者的治疗效果大打折扣。
焦亡,作为一种程序性细胞死亡方式,近年来逐渐进入科研人员的视野。它在 IS 的发生和发展过程中扮演着重要角色,就像一把 “双刃剑”,过度的焦亡会引发炎症反应,进一步加重脑组织的损伤。然而,目前对于焦亡在 IS 脑组织中的具体作用机制以及潜在的治疗靶点,科学界仍知之甚少。在这样的背景下,来自昆明医科大学第一附属医院的研究人员决心深入探索,挖掘其中的奥秘,为 IS 的治疗开辟新的道路。

研究人员围绕 IS 与焦亡展开了一系列深入研究,最终在《BMC Medical Genomics》上发表了重要成果。他们发现 Irf1、Icam1、Tlr2、Cebpb 和 Il1rn 这几个基因,是与 CIRI 焦亡密切相关的枢纽基因,而且这些基因与不同免疫细胞存在关联。这一发现意义重大,为从焦亡角度预防和治疗 IS 提供了全新的靶点,就像在黑暗中为后续研究照亮了一条新的道路。

为了开展这项研究,研究人员采用了多种先进的技术方法。首先,从基因表达数据库(Gene Expression Omnibus,GEO)和 GeneCards 数据库获取小鼠 CIRI 相关基因以及焦亡相关基因(PRGs)的数据。然后,利用生物信息学分析手段,如 LASSO 回归构建预后模型,进行功能富集分析(包括基因本体论(GO)、京都基因与基因组百科全书(KEGG)、基因集富集分析(GSEA)和基因集变异分析(GSVA)),筛选枢纽基因,并构建 mRNA - miRNA - lncRNA 相互作用网络。此外,还通过动物实验,选用 C57BL/6 小鼠构建大脑中动脉闭塞(MCAO)模型,运用酶联免疫吸附测定(ELISA)、逆转录聚合酶链反应(RT - PCR)、蛋白质免疫印迹(western blot)和免疫荧光等技术对枢纽基因进行验证。

下面来看具体的研究结果:

  1. 筛选与分析 PRGs:研究人员经过筛选得到 272 个 PRGs 和 35 个焦亡相关差异表达基因(PRDEGs)。通过对 PRGs 进行相关性分析发现,近 37% 的选定 PRGs 基因对之间存在≥0.6 的正相关,超 23% 存在≥ - 0.6 的负相关。与正常样本相比,GSE202659 数据中提取出 31 个上调基因和 4 个下调基因。
  2. 构建风险模型:基于 GSE131193 数据中的 PRGs 进行单因素逻辑回归分析和 LASSO 回归,构建出包含 8 个基因的风险预测模型(AUC = 0.868),该模型在外部数据集 GSE137482 上验证具有良好的预测性能。
  3. 功能富集分析:对 35 个 PRDEGs 进行 GO 和 KEGG 富集分析,结果显示 PRGs 主要与细胞因子产生的正调控、膜筏等相关,在 NOD 样受体信号通路、脂质与动脉粥样硬化等途径富集。GSEA 和 GSVA 分析也进一步证实了 PRGs 与相关信号通路的关联。
  4. 筛选枢纽基因:运用 WGCNA 分析,结合 STRING 数据库和 Cytoscape 软件构建蛋白质 - 蛋白质相互作用(PPI)网络,筛选出 7 个枢纽基因:Irf1、Icam1、Tlr2、Tnf、Cebpb、Il1rn 和 Casp8。
  5. 构建 ceRNA 网络与免疫浸润分析:利用 starBase 数据库构建 ceRNA 网络,并进行免疫细胞浸润分析。发现 Cebpb、Il1rn 和 Casp8 与 NK 细胞活化程度呈正相关,Icam1 与记忆 B 细胞呈负相关。
  6. 动物实验验证:构建 MCAO 小鼠模型,实验结果表明,与假手术组相比,MCAO 组小鼠神经功能缺损评分更高,脑梗死体积更大,焦亡相关基因的 mRNA 和蛋白表达水平上调,血清中 IL - 1β 和 IL - 18 水平增加。同时,Irf1、Icam1、Tlr2、Cebpb 和 Il1rn 在 MCAO 组小鼠大脑中的 mRNA 表达水平显著升高。

在研究结论与讨论部分,研究人员指出,Irf1、Icam1、Tlr2、Cebpb 和 Il1rn 是 CIRI 焦亡的关键枢纽基因。虽然目前对于这些基因在 CIRI 和焦亡过程中的具体功能尚未完全明确,但已有的研究成果为 IS 的治疗提供了新的方向。不过,该研究也存在一定的局限性,如仅在基因层面进行分析,未深入探究蛋白质表达,且实验仅基于小鼠模型,结论对人类脑卒中的适用性还需更多临床样本验证。未来,研究人员计划通过更多体内外实验进一步验证这些基因的功能,扩大样本量深入挖掘生物学机制,为 IS 的治疗带来更多突破。

总的来说,这项研究为缺血性脑卒中的治疗开辟了新的方向,虽然还有很长的路要走,但每一步的探索都让我们离攻克这一难题更近了一步,期待未来能取得更多令人振奋的成果。
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