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为探究维生素 C 抗 EBV 和 PTC 的作用机制,研究人员构建风险模型,筛选出核心靶点,为治疗提供新方向。
甲状腺,这个形似蝴蝶的小器官,却在人体内分泌系统中占据着重要地位。甲状腺乳头状癌(Papillary Thyroid Carcinoma,PTC)是甲状腺癌中最为常见的类型,近年来,其发病率在全球范围内持续攀升,严重威胁着人们的健康。爱泼斯坦 - 巴尔病毒(Epstein-Barr Virus,EBV)作为一种广泛传播的人类疱疹病毒,不仅与多种疾病的发生发展密切相关,越来越多的研究还发现它与 PTC 之间似乎存在着千丝万缕的联系。然而,目前针对 EBV 的特效治疗药物相对有限,现有的抗病毒药物在疗效和安全性方面也有待进一步验证。与此同时,虽然维生素 C 在临床实践中展现出了抗菌和抗肿瘤的潜力,但其对抗 EBV 感染和甲状腺癌的具体机制却一直是个未解之谜。
为了揭开这些谜团,为 PTC 的治疗开辟新的道路,沧州市中心医院的研究人员开展了一项极具意义的研究。他们的研究成果发表在《Discover Oncology》杂志上,为该领域的发展带来了新的曙光。
在这项研究中,研究人员运用了多种前沿技术。他们从多个数据库中筛选数据,如从 GEPIA2 数据库获取 PTC 相关差异表达基因(Differentially Expressed Genes,DEGs),从 GEO 数据库下载相关微阵列数据集,从 GeneCards 数据库收集 EBV 相关基因。同时,利用 Xiantao 学术工具进行基因本体(Gene Ontology,GO)分析和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)分析,还借助 Cytoscape 软件构建蛋白质 - 蛋白质相互作用(Protein-Protein Interaction,PPI)网络,通过分子对接技术探究维生素 C 与核心靶点的结合情况 。
研究结果丰富且具有重要价值。在 PTC/EBV 相关基因的鉴定与富集分析方面,研究人员通过交叉分析,确定了 118 个 PTC/EBV 相关重叠基因。这些基因在生物过程(Biological Process,BP)中,主要影响伤口愈合、活性氧代谢过程等;在细胞成分(Cellular Component,CC)方面,主要涉及含胶原的细胞外基质等;在分子功能(Molecular Function,MF)方面,主要参与胶原结合等;在 KEGG 通路中,主要涉及病毒性心肌炎、EBV 感染等相关通路。
接着,研究人员构建了 PTC/EBV 相关基因风险模型并进行诊断和预后分析。他们从 118 个重叠基因中筛选出 25 个枢纽基因,经过单变量和多变量 Cox 回归分析,确定了 STAT1、APOE 和 FGF7 这三个核心基因,并构建了预后模型。该模型在 TCGA 队列中的 1 年、2 年和 3 年的预测模型 AUC 分别为 0.793、0.818 和 0.779,在 GPL570 中的 AUC 为 0.852,展现出良好的诊断效率。K-M 曲线也表明该模型具有良好的预后价值。
在预后分析中,研究人员发现年龄、病理分期、T 分期和风险评分与 PTC 患者的预后显著相关,年龄可能是影响 PTC 的独立预后因素。并且,该预后模型在大多数亚组中表现良好。
临床信息分析显示,与正常甲状腺组织相比,STAT1 和 APOE 在 PTC 中高表达,FGF7 在 PTC 中低表达。且这些核心基因在不同亚组中的表达存在差异,提示它们可能在 PTC 发展的不同阶段发挥重要作用。
肿瘤免疫浸润分析表明,PTC/EBV 相关基因的表达与免疫细胞浸润密切相关。核心基因 STAT1、APOE 和 FGF7 与多种免疫细胞显著相关,其表达水平与 PTC 的免疫微环境密切相关。
研究人员还鉴定了维生素 C 抗 PTC/EBV 的核心靶点。通过数据库筛选和分析,确定了 11 个维生素 C 抗 PTC/EBV 的靶基因,并进一步筛选出 LGALS3、MMP9、CTSB 和 CTSS 这四个核心靶点。分子对接结果显示,维生素 C 与这些核心靶点具有良好的结合潜力。
总的来说,该研究通过对 PTC/EBV 相关基因的鉴定和功能分析,揭示了 PTC/EBV 相关基因在 PTC 进展中的潜在机制,构建了有效的预后模型,并找到了维生素 C 的结合靶点。虽然研究存在一定局限性,如缺乏实验验证、未在实际 EBV 感染的 PTC 患者中验证等,但这些发现为进一步的实验研究提供了重要基础,有望改善 PTC 的预后和治疗策略,为未来 PTC 的精准治疗提供新的方向和思路。