多组学分析揭示 OSGEPL1 在肝细胞癌中的致癌新机制

研究针对肝细胞癌（HCC）治疗难题，分析 t6A 相关基因，发现 OSGEPL1 或为新治疗靶点。

　　

肝细胞癌（Hepatocellular Carcinoma，HCC）作为原发性肝癌的主要类型，在全球范围内严重威胁人类健康，是癌症相关死亡的第三大原因。尽管近年来靶向治疗和免疫检查点抑制剂有所进展，但晚期 HCC 患者的治疗反应率仍不尽人意。目前，人们逐渐认识到表观遗传改变在 HCC 的发展中起着重要作用，其中 RNA 修饰更是备受关注。然而，N⁶- 苏氨酰氨甲酰腺苷（t⁶A）修饰在 HCC 中的潜在作用却一直未被完全阐明。

为了填补这一知识空白，中山大学孙逸仙纪念医院的研究人员开展了一项深入研究。他们的研究成果发表在《Discover Oncology》上，为 HCC 的治疗和预后评估带来了新的希望。

研究人员主要运用了多组学分析技术，包括从 The Cancer Genome Atlas（TCGA）数据库获取 RNA 测序（RNA-seq）数据和临床数据，进行基因表达分析、生存分析、功能富集分析、免疫细胞浸润分析以及体细胞突变分析等；同时还进行了体外细胞实验，如细胞转染、RNA 提取与定量逆转录聚合酶链反应（qRT-PCR）、蛋白质免疫印迹（Western blot）分析、细胞计数试剂盒 8（CCK-8）检测、克隆形成实验和 5 - 乙炔基 - 2'- 脱氧尿苷（EdU）检测等。

在研究结果方面：

1. t⁶A 相关基因表达广泛改变：研究人员对比了 33 种不同癌症的肿瘤组织和正常组织中 7 种 t⁶A 相关基因（OSGEP、OSGEPL1、TPRKB、GON7、TP53RK、YRDC 和 LAGE3）的表达水平。结果发现，这些基因在多种癌症中存在异常表达，其中在肝癌（LIHC）、胆管癌（CHOL）和胃腺癌（STAD）中高表达明显，而在肾嫌色细胞癌（KICH）中普遍下调。这表明 t⁶A 甲基化途径在 HCC 中异常激活。

2. OSGEPL1 表达与 HCC 预后不良相关：通过单因素 Cox 回归分析发现，OSGEPL1 的风险比（HR）较高，具有显著的预后价值。进一步研究证实，HCC 组织中 OSGEPL1 蛋白表达明显高于正常肝组织，且其高表达与更高的组织学分级、T 分期和病理分期相关。Kaplan-Meier（KM）分析结果显示，高 OSGEPL1 表达与 HCC 患者总生存期（OS）较差相关，在多个亚组分析中也得到了同样的结论。

3. OSGEPL1 在 HCC 中的生物学功能和机制：对高、低 OSGEPL1 表达亚组进行差异表达基因（DEGs）分析，发现高 OSGEPL1 表达亚组中与细胞周期和 Wnt 信号通路相关的基因显著富集；低 OSGEPL1 表达亚组中与 DNA 复制、错配修复、化学致癌过程中活性氧生成等相关的基因显著富集。基因集富集分析（GSEA）结果表明，高 OSGEPL1 表达亚组中增殖相关通路富集，低 OSGEPL1 表达亚组中免疫反应通路富集。这揭示了 OSGEPL1 可能通过激活细胞周期和 Wnt 信号通路促进肝癌细胞增殖和生长，进而推动 HCC 的发展。

4. OSGEPL1 与免疫状态的关系：研究发现，OSGEPL1 高表达与多种免疫细胞（如活化的 CD8⁺T 细胞、NKT 细胞、NK 细胞等）的低浸润显著相关，与免疫抑制细胞（如 M2 巨噬细胞和 MDSCs）的浸润呈正相关，还与免疫调节分子（如 CD276、ADORA2A 等）水平升高有关。这表明 OSGEPL1 在调节 HCC 免疫抑制肿瘤微环境（TME）中发挥潜在作用。

5. 体细胞突变与 OSGEPL1 表达的关联：瀑布图展示了低、高 OSGEPL1 表达亚组的基因突变情况，发现两个亚组中常见的突变基因有所不同，且高 OSGEPL1 表达亚组中共同发生的突变更为频繁。突变富集分析显示，多个基因的突变频率在高、低 OSGEPL1 表达亚组中存在差异。

6. OSGEPL1 对 HCC 细胞增殖的调控作用：体外实验中，通过小干扰 RNA（siRNA）敲低 HCC 细胞系中 OSGEPL1 的表达，结果显示细胞增殖速率降低。进一步研究发现，敲低 OSGEPL1 可上调 p27，下调 Cyclin A，表明 OSGEPL1 在维持 HCC 细胞周期进展和促进细胞增殖中发挥重要作用。

7. 基于 OSGEPL1 的预后预测模型：受试者工作特征（ROC）分析表明，OSGEPL1 区分正常和 HCC 组织的曲线下面积（AUC）为 0.931，是有潜力的生物标志物。单因素 Cox 回归分析确定病理 T 分期和 OSGEPL1 是 OS 的重要预测指标，基于此构建的预后列线图对 1 - 5 年的 OS 率具有较高的预测准确性，其预后预测价值优于其他临床特征。

综上所述，该研究揭示了 OSGEPL1 在 HCC 中的重要作用。它不仅为深入理解 t⁶A 修饰失调的分子机制提供了新视角，还将 OSGEPL1 确定为潜在的治疗靶点和预后生物标志物，为肝癌新治疗策略的开发提供了理论依据，有望推动肝癌个性化治疗的发展，改善患者的预后。