一种用于诱导多能干细胞衍生心肌细胞(iPSC-CMs)的高性能细胞外场电位分析仪

【字体: 时间:2025年03月16日 来源:Scientific Reports 3.8

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  研究人员开发 EFP-Analyzer 分析 iPSC-CMs 的 EFP,能可靠检测药物及病理改变,推动药物筛选。

  ### 探秘心脏研究新利器:解锁 iPSC-CMs 的电生理密码
在心脏研究的神秘领域,诱导多能干细胞衍生心肌细胞(induced pluripotent stem cell-derived cardiomyocytes,iPSC-CMs)宛如一颗新星,自 2006 年诱导多能干细胞(iPSCs)被发现后,它迅速成为研究的焦点。iPSC-CMs 可用于模拟细胞行为、药物反应和疾病,尤其在药物安全筛选方面意义重大,能检测出延长心脏动作电位持续时间的药物。然而,心脏研究的道路并非一帆风顺。心血管问题导致众多临床试验失败,比如在 2000 年代,因心血管问题,非临床阶段试验放弃率达 27%,I - III 期为 21%,批准后高达 45%。为了阻止具有致心律失常风险的药物进入市场,科研人员努力开展临床前试验评估 hERG 抑制作用,但传统研究方法存在诸多挑战。
细胞外场电位(Extracellular Field Potential,EFP)就像是心肌细胞跳动的 “心电图”,由离子跨细胞膜运动产生,能反映心肌细胞的跳动模式。不过,与广泛应用且经过大量验证的心电图(ECG)分析软件不同,EFP 测量的一致性和可靠性缺乏研究,也没有标准化的分析工具。此前的研究方法,要么沿用为体内动物分析设计的软件,要么采用自定义方法,却都未评估这些策略的可靠性,这无疑给研究带来了重重阻碍。

为了突破这些困境,来自范德堡大学医学院(Vanderbilt University School of Medicine)等机构的研究人员踏上了探索之旅。他们致力于开发一种高效的分析工具,以更好地利用 iPSC-CMs 进行药物筛选和疾病建模研究。最终,他们成功开发出 EFP-Analyzer(EFPA)这一半自动化软件工具,相关研究成果发表在《Scientific Reports》上。

研究人员在研究过程中运用了多种关键技术方法。首先是 iPSC 系的生成,他们从 15 名无已知先天性心律失常综合征的参与者外周血中分离单核细胞,通过电穿孔将非整合型附加体质粒载体导入细胞,重编程为 iPSCs,再对其进行验证和扩繁 。接着进行心肌细胞分化,将 iPSCs 诱导分化为心肌细胞,并通过染色验证。对于光学起搏的细胞,还进行了特定病毒载体处理。之后利用 CardioExcyte96 系统测量 EFP 和阻抗信号,记录细胞在光学刺激下的电活动。最后使用 EFPA 软件对数据进行分析,包括选择和平均搏动、识别地标以及计算间隔等操作。

下面来看看具体的研究结果:

  1. EFPA 软件工具解析:EFPA 软件基于 Shiny 框架开发,可在 GitHub 上下载,使用说明详细,兼容多种操作系统。软件分为数据加载和数据分析两个页面,操作流程清晰。其分析参数设置合理,能自动完成部分任务,用户也可手动调整,且计算的参数与评估人类心电图中的心电活动参数类似。
  2. iPSC-CM 系的深度剖析:研究人员对 22 个 iPSC-CM 系进行研究,从最初的 25 个患者系中筛选出 1280 条记录。经过多轮筛选,排除非标准形态的 EFP,最终确定主要数据集。通过不同人员对 EFP 测量的对比发现,标准形态的 EFP 测量重复性最佳。并且,不同测量方法和人员之间的 FPD 测量相关性高,偏差较小,表明 EFPA 测量结果可靠。
  3. 药物反应与疾病研究的新突破:在药物反应研究中,研究人员用莫西沙星(moxifloxacin)处理 iPSC-CMs,发现随着药物浓度增加,FPDmax 显著延长。在疾病研究方面,对携带 CACNA1C N639T 突变的细胞系分析显示,该突变细胞系的 FPDmax 相较于对照细胞系明显延长。这表明 EFPA 能够准确检测药物和疾病相关的 EFP 变化。

在研究结论与讨论部分,EFPA 展现出诸多优势。它在分析 22 个患者系的 358 条 EFP 痕迹时,测量结果一致,能可靠检测出药物(如莫西沙星)和病理(如 CACNA1C N639T 突变)引起的功能变化。不同读者间 FPD 测量的相关性系数高,Bland - Altman 图显示一致性良好,这意味着该技术能实现高质量的数据采集,在不同用户和研究间具有可重复性。与其他工具相比,EFPA 在分析 iPSC-CM 数据时更具优势,如采用切线法、可手动调整搏动、数据存储功能完善等,能提高测量的精度和准确性。

不过,研究也存在一定的局限性。iPSC-CMs 存在表型不成熟的问题,这可能影响疾病和药物建模的预测准确性。此外,EFPA 仅针对特定设备产生的 EFP 数据进行优化,对于其他设备产生的数据兼容性有待进一步测试。未来研究可从多个方向展开,比如探索更多 EFP 参数、研究不同离子通道突变的影响、采用不同细胞培养方式等,以进一步挖掘 EFPA 的潜力。

总的来说,EFPA 的出现为心脏研究领域带来了新的曙光,它为药物筛选和疾病建模提供了更高效、准确的工具,推动了 iPSC-CMs 在心血管研究中的应用,尽管存在一些不足,但也为后续研究指明了方向,激励着科研人员不断探索,为心脏健康研究开辟更广阔的道路。

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