花生 RALF 基因家族研究:解锁生长与抗逆新奥秘

【字体: 时间:2025年03月16日 来源:BMC Plant Biology 4.3

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  研究人员为探究花生 RALF 基因功能,开展相关研究,发现其在生长和铝胁迫响应中的作用,为花生育种奠基。

  花生,作为全球重要的油料和经济作物,在农业经济中占据着举足轻重的地位。然而,它的生长却面临着诸多挑战,其中铝(Al)毒性和水分亏缺对花生的产量影响尤为显著。在植物的生长调控和应激反应中,快速碱化因子(RALFs)是一类重要的小肽激素,虽然它在多种陆地植物中已被识别,但在花生中,RALF 基因的功能却鲜为人知。为了填补这一知识空白,广西大学等研究机构的研究人员开展了花生 RALF 基因家族的相关研究,其成果发表在《BMC Plant Biology》上,为深入了解花生生长调控和抗逆机制奠定了基础。
研究人员主要运用了以下关键技术方法:首先通过数据库检索获取拟南芥 RALF 基因序列,利用 BLAST 搜索在花生基因组中鉴定 AhRALF 基因;然后借助 MEGA 11.0.13 等软件对 RALF 基因进行系统发育分析;运用 TBtools 软件进行基因结构、染色体定位等分析;采用 RNA-seq 和定量实时 PCR(qRT-PCR)技术研究基因表达模式;通过构建载体转化烟草、酵母及拟南芥等进行功能验证。

研究结果如下:

  • 花生 RALF 基因的鉴定与进化分析:研究人员通过两轮 BLAST 搜索,在花生基因组中成功鉴定出 24 个 AhRALF 基因。系统发育分析显示,这些基因可分为三个进化枝(clade),且 AhRALFs 与拟南芥 RALF 基因在进化上存在一定的亲缘关系。进一步分析发现,全基因组复制(WGD)或片段复制是 AhRALFs 基因家族扩张的主要驱动力,约 2500 万年前发生的这些复制事件,使得花生中出现了许多旁系同源基因对和基因簇12
  • 基因结构与保守基序分析:所有 AhRALF 基因均只含有一个外显子,无内含子。在保守基序方面,多数 AhRALFs 含有 RRXL 和 YISY 结构域,且所有成员都含有 C 末端 RGC5NC 结构域。不过,进化枝 I 中的 AhRALFs 缺少 RRXL 结构域,这表明它们可能需要通过独立于 RRXL 的机制进行成熟加工34
  • 顺式作用元件分析:对 AhRALFs 基因启动子区域的顺式作用元件分析发现,与植物激素响应相关的元件广泛存在。其中,与脱落酸(ABA)响应相关的元件数量最多,此外还包括生长素、茉莉酸甲酯(MeJA)等激素响应元件,这暗示着 AhRALFs 可能在多种激素调控途径中发挥作用56
  • 基因表达模式分析:基于 RNA-seq 数据的研究表明,进化枝 I 中的 AhRALF 基因在 18 种检测组织及铝胁迫下均不表达;进化枝 II 中的 AhRALF1 和 AhRALF12,以及进化枝 III 中的 AhRALF8、AhRALF10、AhRALF15 和 AhRALF21 在多数组织中高表达。部分基因如 AhRALF11 和 AhRALF24 具有严格的组织特异性,仅在未成熟的芽和花中高表达。在铝胁迫下,多个基因的表达受到显著抑制,研究人员对这些铝响应基因进行了深入研究78
  • AhRALF1 的功能验证:AhRALF1 经研究被选定进行深入功能探究。通过构建 35S:AhRALF1-GFP 融合蛋白载体转化烟草叶片表皮细胞,以及利用酵母突变株 YTK12 进行实验,证实了 AhRALF1 具有分泌功能。体外实验表明,外源 AhRALF1 肽处理的拟南芥根相对伸长率仅为 27.69%,转基因拟南芥过表达 AhRALF1 后根长显著缩短,这表明 AhRALF1 对根生长具有抑制作用。在铝胁迫下,过表达 AhRALF1 的转基因拟南芥相对根伸长率高于野生型,且根损伤程度较轻;而花生中 AhRALF1 基因沉默植株对铝胁迫的耐受性降低,抗氧化酶活性改变,氧化损伤增加,这表明 AhRALF1 在调节花生对铝胁迫的耐受性中发挥着重要作用910

研究结论和讨论部分指出,该研究全面分析了花生 AhRALF 基因家族,明确了其在花生生长发育和胁迫响应中的重要作用。AhRALF1 在调节花生对铝胁迫的耐受性方面表现突出,其作用机制可能与调节抗氧化酶活性、维持细胞内活性氧(ROS)平衡有关。然而,研究中也发现进化枝 I 中的 AhRALFs 具有一些特殊结构和表达模式,其功能仍有待进一步探索。此外,虽然研究揭示了 AhRALFs 与植物激素响应元件的关联,但它们在激素信号通路中的具体作用机制还需更多研究加以阐明。

总的来说,这项研究为花生的基础研究和育种实践提供了宝贵的信息,有助于科研人员进一步理解花生生长和抗逆的分子机制,为培育更具抗逆性的花生品种提供了理论依据,对推动花生产业的可持续发展具有重要意义。

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