小麦抗叶枯病基因 Stb15 的奥秘:从发现到应用的突破

【字体: 时间:2025年03月15日 来源:Nature Plants 15.8

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  为解决小麦叶枯病(STB)问题,研究人员开展 Stb15 基因研究,证实其编码凝集素受体样激酶,意义重大。

  小麦,作为全球最重要的粮食作物之一,养活了数十亿人口。然而,有一种看不见的 “敌人”,长期以来一直威胁着小麦的产量和质量,它就是由真菌 Zymoseptoria tritici 引起的小麦叶枯病(Septoria tritici blotch,STB)。每年,全球因 STB 损失的小麦高达约 2400 万吨,农民们不得不投入大量资金使用杀菌剂来对抗它,但这不仅增加了生产成本,还可能对环境造成负面影响。为了找到更有效、更环保的解决办法,来自英国约翰英纳斯中心(John Innes Centre)等多个机构的研究人员展开了深入研究,相关成果发表在《Nature Plants》上。
在过去的研究中,虽然已经发现了一些控制小麦对 STB 抗性的基因(Stb 基因),但对这些基因的克隆和作用机制的了解还相对有限。Stb15 作为一个对特定 Z. tritici 分离株具有显著抗性的基因,引起了研究人员的极大兴趣。它不仅在欧洲小麦品种中广泛存在,而且对无毒分离株能产生完全抗性,这在 Stb 基因中是较为罕见的,因此成为研究 STB 抗性生物学的理想候选基因。

为了深入探究 Stb15 基因的奥秘,研究人员利用了一个独特的资源 ——Watkins collection,这是一组代表绿色革命前小麦遗传多样性的地方品种。研究人员对 300 个 Watkins 品系进行了全基因组鸟枪法测序,并通过接种 Z. tritici 的不同分离株 IPO323 和 IPO88004,观察小麦的发病症状,记录叶损伤和分生孢子器覆盖情况,计算疾病进展曲线下面积(AUDPC)。

接着,研究人员使用全基因组关联研究(GWAS)方法,结合统计分析,成功将 Stb6 基因定位到一个离散的基因组区间,同时也确定了与 Stb15 基因相关的区域。通过对候选基因的进一步筛选和分析,研究人员最终确定了 TraesCS6A02G078700(中国春)/TraesARI6A03G03215890(ArinaLrFor)为 Stb15 的最可能候选基因。

为了验证这一结果,研究人员进行了突变分析和转基因实验。他们在 Arina 的 EMS 诱变群体中筛选出了三个对 IPO88004 敏感的突变体,这些突变体在 Stb15 候选基因的开放阅读框中均发生了非同义转换突变。同时,将包含 Stb15 基因的序列转化到对 IPO88004 敏感的小麦品种 Fielder 中,结果表明转基因植株对该分离株产生了抗性,而对照植株则易感,这证实了 TraesARI6A03G03215890 就是 Stb15 基因,且它编码一种凝集素受体样激酶(lectin receptor kinase,LecRK)。

研究还发现,Stb15 基因在不同小麦品种和相关物种中存在多种等位基因和同源基因。其功能等位基因在 Watkins 核心 300 品系中虽仅占 15%,但分布广泛,常与 Stb6 基因同时出现。此外,Stb15 基因的内含子 / 外显子结构在不同物种中存在多样性,功能等位基因无内含子,而中国春品种中该基因有四个内含子。

在研究过程中,研究人员主要运用了以下关键技术方法:一是全基因组关联研究(GWAS),对 Watkins collection 中的小麦地方品种进行研究,定位与 STB 抗性相关的基因位点;二是突变分析,通过 EMS 诱变构建 Arina 的突变群体,筛选与 Stb15 功能相关的突变体;三是转基因技术,将候选的 Stb15 基因转化到易感小麦品种中,验证其功能。

从研究结果来看,在定位 Stb15 基因方面,通过 GWAS 结合表型分析,确定了位于 6AS 染色体上的一个 99-kb 区域与 Stb15 抗性相关,最终锁定了 TraesARI6A03G03215890 为候选基因。对 Stb15 基因功能验证发现,突变分析和转基因实验证实该基因编码的 LecRK 对小麦抵抗 Z. tritici 具有关键作用。而关于 Stb15 基因的多样性研究,发现其在不同小麦品种和相关物种中存在多种等位基因和同源基因,基因结构存在差异。

总的来说,这项研究成功克隆了 Stb15 基因,并明确其编码一种凝集素受体样激酶,这极大地增进了人们对小麦与 Z. tritici 相互作用分子机制的理解,为小麦抗 STB 育种提供了重要的理论依据和基因资源。同时,研究还展示了 GWAS 在克隆分子水平了解较少的性状基因方面的强大作用,为其他类似研究提供了借鉴。未来,有望基于这些发现开发出更有效的小麦抗 STB 策略,减少小麦产量损失,保障全球粮食安全。

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