链霉菌 Streptomyces sp. SM1P:次级代谢产物的潜力挖掘与研究
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研究人员对链霉菌 Streptomyces sp. SM1P 开展研究,发现其具产新次级代谢物潜力,意义重大。
对链霉菌(Streptomyces)sp. SM1P 的基因组进行测序,得到了长度为 7,561,428 bp、GC 含量为 71.7% 的重叠群,以及 24 个推定的次级代谢产物生物合成基因簇(BGCs)。其中,8 个 BGCs 与已知 BGCs 相似度高(≥80%),3 个相似度中等(50 - 79%),11 个相似度低(小于 50%)。该菌株在 3 种不同溶剂配制的 7 种培养基中培养,用乙酸乙酯提取次级代谢产物,得到 21 种不同提取物。所有提取物均表现出抗菌和细胞毒性活性,ISP1/NaCl 培养物的提取物对细菌活性最强,ISP4/ASW 培养物的提取物对卤虫无节幼体活性最强。在薄层层析(TLC)上出现大量斑点的 ISP2/NaCl 培养物的提取物,对伯氏疟原虫(Plasmodium berghei)也有活性。利用气相色谱 - 质谱(GC - MS)对 ISP1/NaCl、ISP2/NaCl 和 ISP4/ASW 提取物进行非靶向代谢组学分析,并与美国国家标准与技术研究院 20 质谱库数据对比,发现它们的次级代谢产物存在差异。对质荷比(m/z)值进行主成分分析(PCA)显示,ISP1/NaCl 和 ISP2/NaCl 之间存在相关性,而与 ISP4/ASW 无相关性。利用液相色谱 - 质谱 / 质谱(LC - MS/MS)对 ISP2/NaCl 提取物进行代谢组学分析,并与全球天然产物社会分子网络(GNPS)数据库等数据对比,表明存在一种兰卡霉素衍生物(一种抗生素)和一种环孢素衍生物(一种免疫抑制剂)。然而,还有许多其他代谢物未匹配到。结果表明,
链霉菌 Streptomyces sp. SM1P 有作为新型次级代谢产物产生菌的潜力,尤其是具有抗菌和抗肿瘤活性的次级代谢产物。
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