编辑推荐:
为探究 ARFs 如何选靶基因,研究人员用多种技术研究其 DBD 结合机制,发现新规律,助力理解生长素反应。
植物的生长发育主要受植物激素生长素(auxin)的调控,生长素可激活生长素响应因子(ARFs)。尽管对核生长素途径(NAP)已有深入研究,但 ARFs 如何特异性选择靶基因却知之甚少。在此,研究人员利用荧光各向异性、尺寸排阻色谱、大分子晶体学(MX)和小角 X 射线散射(SAXS)技术,对进化上距离较远的两种植物 —— 地钱(Marchantia polymorpha)和拟南芥(Arabidopsis thaliana)中,来自激活类 A 和抑制类 B 的 ARF DNA 结合结构域(DBD)的 DNA 结合机制展开研究。研究发现,此前提出的分子卡尺模型在进化过程中得以保留,该模型能部分解释 ARFs 与 DNA 结合的差异。研究结果还显示,B 类 MpARF2的 DBD 表现更像 A 类 AtARF5,而非 B 类 AtARF1。这些发现表明,ARFs 对 DNA 的识别与转录输出相互独立,这对理解植物对生长素的多样反应具有重要意义。此外,文章还展示了地钱 ARF2 DBD 与双链 DNA(dsDNA)结合的两种晶体结构,并对多种 ARF DBD 与 DNA 的结合进行了广泛的生物物理分析,相关数据揭示了全长 ARF 分类与 DBD DNA 结合行为的解耦现象。