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为解决印度玫瑰木研究与保护难题,研究人员开展基因组测序,获高质量结果助力相关领域。
木材作为一种天然且可持续的能源,是化石燃料的生态高效替代品,在稳固木本植物以及将水分输送到植物各个部分方面发挥着重要作用。在过去几十年里,人们对细胞木材形成(木质化,xylogenesis)的认识有了显著提升。印度玫瑰木(Dalbergia latifolia),通常被称为 “印度玫瑰木”,是来自印度 - 马来西亚地区的优质木材品种。这种生长缓慢的树木因其耐用的木材而备受珍视,其木材比柚木更坚固、更坚硬,并且具有天然的抗虫害和抗真菌侵袭能力。然而,对玫瑰木不断增长的需求,尤其是来自中国的需求,导致了非法采伐的增加,它也被列入《濒危野生动植物种国际贸易公约》(CITES)附录 2。到 2020 年底,印度玫瑰木根据世界自然保护联盟濒危物种红色名录(IUCN Red List of Threatened Species)的 A1cd 标准被评估为全球易危物种。在印度,其主要威胁包括由于商业需求上升导致的再生不足和生长缓慢。作为回应,印度已禁止该物种的原木和锯材出口。尽管印度玫瑰木具有重要的生态和经济意义,但一直缺乏基因组层面的信息,这阻碍了科学研究和保护工作。这项研究对印度玫瑰木进行了全面的从头基因组测序(de novo genome sequencing)和组装,为其遗传组成和潜在应用提供了宝贵见解。研究生成了 22,319 个重叠群(contigs),总计 613.95 Mb,完整性高达 95%,单拷贝直系同源基因(single-copy BUSCO genes)识别率为 92%。
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