《Nature》新线粒体蛋白数据集助力精确定位真核生物生命树（eToL）根部

为定位真核生物生命树（eToL）根部，研究人员分析新数据集，确定根部位置，意义重大。

　　

真核生物生命树（eToL）描绘了所有真核生物之间的关系，其根部代表最后真核共同祖先（LECA），现存所有复杂生命形式都由它演化而来。确定这一根部位置对于重建 LECA 的特征至关重要，LECA 既是真核生物起源的终点，也是支撑现存真核生物多样化的众多复杂性状演化的起点。然而，由于进化模型不完善、分类群采样不足和系统发育信号有限导致普遍存在系统发育假象，根部位置一直存在争议。此次，研究人员基于一个新的、规模大得多的线粒体蛋白数据集（涵盖所有已知的真核超群）以前所未有的分辨率估计了 eToL 的根部。他们对一个包含 100 个分类单元 ×93 种蛋白质的数据集进行分析，并使用最先进的系统发育模型，广泛评估了其他假设。结果显示，真核生物的根部位于两个多超群组合 “Opimoda+” 和 “Diphoda+” 之间。这一位置在不同模型和稳健性分析中都得到了一致支持。值得注意的是，含有 “典型挖掘类群” 的群体位于根部两侧，这表明 “挖掘类群” 细胞结构的复杂特征可追溯到 LECA。这项研究为现存真核生物的起源提供了线索，为研究真核生物典型特征的起源和演化提供了关键框架。