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为探究登革病毒(DENV)感染机制,研究人员整合测序数据,确定关键调控对,助力诊疗发展。
登革病毒(Dengue virus,DENV)由伊蚊传播,可引发从轻度登革热到严重登革出血热和登革休克综合征等多种疾病。了解 DENV 感染的分子机制对开发有效的诊断方法和治疗手段至关重要。本研究整合
mRNA 和
miRNA 测序数据,探索 DENV 感染过程中的调控网络。研究分析了 DENV 感染样本和对照样本,通过差异表达分析鉴定出显著变化的基因和 miRNA。利用 miRNet 确定差异表达 miRNA(Differentially Expressed miRNAs,DEMs)的靶基因,借助 Metascape 对靶基因进行功能富集分析。运用皮尔逊相关分析确定 miRNA 和 mRNA 之间的潜在调控关系,并通过受试者工作特征(Receiver Operating Characteristic,ROC)分析评估关键 miRNA - mRNA 对的诊断潜力。差异表达分析揭示了一组独特的差异表达基因(Differentially Expressed Genes,DEGs)和 miRNA。功能富集分析表明,上调基因参与 DNA 模板转录和细胞分裂等过程,而下调基因与 TNF - α 信号通路和血管发育相关。皮尔逊相关分析突出了关键的负相关 miRNA - mRNA 对。ROC 分析显示,如 TUBA1A - hsa - mir - 205 - 5p、CXCL16 - hsa - mir - 205 - 5p、MED29 - hsa - mir - 148b - 5p、PPARA - hsa - mir - 3614 - 5p 和 PTPRJ - hsa - mir - 96 - 5p 等对具有高诊断潜力,曲线下面积(Area Under the Curve,AUC)值为 1。该研究为 DENV 感染中的 miRNA - mRNA 调控网络提供了有价值的见解,识别出潜在的治疗靶点和诊断关键基因。所确定的 miRNA - mRNA 相互作用为开发靶向治疗方法和改进 DENV 诊断提供了有前景的途径,有助于更好地管理登革病毒感染。
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