美国东北部发现逃避诊断的沙眼衣原体变体，改写性传播感染检测认知

研究针对性传播感染（STI）检测结果差异，分析宫颈阴道微生物组，发现逃避诊断的沙眼衣原体（CT）变体，为检测改进提供依据。

　　# 检测背后的 “隐情”：性传播感染新发现
在性传播感染（STI）的检测领域，一直存在着一些困扰研究人员和临床医生的难题。传统的核酸扩增检测（NAAT）技术，如 Aptima Combo 2 检测，在检测沙眼衣原体（Chlamydia trachomatis，CT）和淋病奈瑟菌（Neisseria gonorrhoeae，NG）感染时，有时会出现令人疑惑的结果。一些患者明明有感染的迹象，但检测结果却显示阴性，这不仅可能延误治疗，还会对疾病防控造成阻碍。为了揭开这些 “假阴性” 结果背后的真相，来自美国北卡罗来纳州立大学、北卡罗来纳大学教堂山分校以及匹兹堡大学等机构的研究人员开展了一项重要研究，相关成果发表在《BMC Infectious Diseases》上。

这项研究主要聚焦于性传播感染检测中的假阴性现象。研究人员从 T 细胞对抗衣原体反应（T Cell Response against Chlamydia，TRAC）队列中选取了 220 名参与者，对他们的宫颈阴道微生物组进行 16S rRNA 分析。TRAC 队列由 246 名感染 CT 高风险的顺性别女性组成，她们在 2011 年 2 月至 2014 年 8 月期间前往宾夕法尼亚州阿勒格尼县卫生局性传播疾病诊所进行 STI 检测和管理。

在研究方法上，研究人员首先构建 16S rRNA 基因文库，对宫颈阴道拭子样本进行微生物组分析。接着，从残留诊断样本中提取 DNA，通过 PCR 模板纯化，进行定量 PCR，测量衣原体和支原体载量。之后，对 23S rRNA 等位基因进行 PCR 扩增和测序，检测单核苷酸多态性（SNP）。最后，运用非参数 Spearman 秩相关系数和 Mann - Whitney 检验等统计方法，分析数据。

研究结果令人惊讶。在 16S rRNA 基因文库分析中，研究人员发现，在 CT 检测呈阴性的参与者样本中，有 7 个样本检测到了衣原体来源的扩增子序列变体（ASV）。通过对这些样本中衣原体 23S rRNA 基因座的分析，发现存在一个 G¹⁵²³A 核苷酸多态性，这是一种逃避诊断的突变，与之前在芬兰、丹麦和英国检测到的变体相同。对于 NG 检测，研究发现有 5 名参与者的检测结果存在差异。尽管 16S rRNA 基因微生物组分析显示这些参与者样本中有 NG 特异性 ASV，但由于感染水平较低，挑战了 NAAT 检测的分辨率极限，导致检测结果出现假阴性。

在讨论部分，研究人员指出，此次发现的 CT 突变，即 G¹⁵²³A 变体，是首次在美国被报道，这表明这种逃避诊断的 CT 变体早在 2012 年或更早就在美国西部宾夕法尼亚州传播。虽然制造商已经认识到并改进了检测方法，通过纳入额外的衣原体靶标提高了可靠性，但依赖基于探针检测单一靶标的测试，仍然容易受到自发点突变的影响，导致检测灵敏度下降。对于 NG 检测，由于其基因组的复杂性，检测的准确性也面临挑战。此次研究还提醒临床医生和流行病学家，要警惕可能逃避当前批准检测方法的 CT 或 NG 变体，及时调整检测策略，避免漏诊。

总的来说，这项研究揭示了性传播感染检测中假阴性结果的潜在原因，即存在逃避诊断的 CT 变体和低水平感染导致的检测困难。这一发现对于改进 STI 检测方法、提高诊断准确性具有重要意义，为未来的临床实践和公共卫生防控提供了关键依据。