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研究人员为预测胃癌患者 PD-L1 表达状态,构建模型并验证,结果表明该模型有较高准确性和可解释性
《基于 CT 影像组学的可解释机器学习模型预测
胃癌 PD-L1 表达状态》解读
在癌症治疗的舞台上,免疫治疗正逐渐崭露头角,成为攻克癌症的新希望。其中,针对程序性死亡配体 1(PD-L1)/ 程序性细胞死亡蛋白 1(PD-1)的免疫检查点抑制剂疗法,在多种癌症治疗中展现出了潜力,胃癌也位列其中。然而,现实却给这份希望泼了冷水,免疫治疗的响应率并不理想。原来,PD-L1 的表达状态与免疫治疗效果紧密相关,只有 PD-L1 高表达的患者,可能从免疫治疗中获益更多。因此,精准地筛选出这类患者,成为了提升免疫治疗效果的关键。
目前,评估 PD-L1 表达状态最常用的方法是免疫组织化学(IHC)。但这种方法存在诸多弊端,它需要获取患者的组织样本,要么通过手术,要么进行内镜组织活检,这不仅费用高昂,还会给患者带来一定的创伤。而且,肿瘤具有异质性,如果活检的组织样本不足,就很难准确判断 PD-L1 的表达情况。所以,寻找一种准确、无创的评估方法迫在眉睫。
为了解决这一难题,广州医科大学附属肿瘤医院等研究机构的研究人员展开了深入研究。他们的研究成果发表在《Cancer Imaging》杂志上,为胃癌的治疗带来了新的曙光。
研究人员采用了多种关键技术方法。首先,他们从两个医疗中心回顾性地招募了 285 例接受过对比增强计算机断层扫描(CECT)和 PD-L1 检测的胃癌患者。然后,从静脉期 CT 图像中提取影像组学特征,为了确保数据的准确性和一致性,对这些特征进行了标准化处理,并通过一系列严格的筛选步骤,最终确定了与 PD-L1 表达状态显著相关的特征。接着,他们运用 11 种机器学习(ML)算法构建预测模型,并使用 SHapley 加法解释(SHAP)方法来提升模型的可解释性。最后,通过一系列的统计分析,评估模型的性能。
下面来看看具体的研究结果。
- 患者特征:研究共纳入 285 例患者,分别分配到训练集(143 例)、验证集(62 例)和测试集(80 例)。在不同数据集之间,患者的基线特征,包括 PD-L1 表达状态、性别、年龄、血清肿瘤标志物和 TNM 分期等,均无显著差异,这为后续研究提供了良好的基础1。
- 影像组学特征选择:从每个感兴趣区域(ROI)提取 476 个影像组学特征,经过层层筛选,最终确定了 9 个与 PD-L1 表达状态显著相关的特征。这些特征均来自小波变换,这表明小波变换在捕捉与 PD-L1 表达相关的影像特征方面具有重要作用2。
- ML 模型的预测性能:11 种预测模型在区分 PD-L1 高表达和低表达状态方面均表现出一定潜力。其中,轻梯度提升机(LGBM)模型脱颖而出,在验证集上达到了最高的曲线下面积(AUC,0.834,95% CI:0.729,0.939),在训练集和测试集中也展现出良好的性能(AUC 分别为 0.841 和 0.822)。该模型校准曲线显示,其预测结果与术后病理 IHC 结果吻合度高,决策曲线分析(DCA)也表明该模型在预测 PD-L1 表达状态方面具有实际临床应用价值3。
- 模型解释:通过 SHAP 方法对 LGBM 模型进行解释。在全局可视化中,发现 wavelet_LL_ngtdm_Busyness、wavelet_HH_glcm_Idn 等特征对模型影响较大。在局部可视化中,以两个典型患者为例,展示了模型如何根据不同特征准确分类患者的 PD-L1 表达状态。
研究结论和讨论部分,进一步强调了该研究的重要意义。研究构建的基于 CECT 影像组学的 LGBM 模型,为预测胃癌患者 PD-L1 表达状态提供了一种无创、可靠的方法。通过 SHAP 方法,提升了模型的可解释性,让临床医生能够更好地理解模型的决策过程,增强了对预测结果的信心。与以往研究相比,该研究纳入了更多病例,使用独立外部数据进行评估,并且系统地比较了多种 ML 算法,确定了 LGBM 模型的优势。不过,研究也存在一些局限性,如回顾性研究设计可能引入偏差,手动分割肿瘤耗时耗力,不同中心的 CT 扫描仪和成像参数存在差异,以及 PD-L1 高表达的最佳临界值尚未明确等。
总体而言,这项研究为胃癌的免疫治疗提供了重要的参考依据,有望帮助临床医生更精准地选择适合免疫治疗的患者,提高治疗效果。虽然还有一些问题需要进一步研究解决,但它无疑为未来的研究指明了方向,为胃癌患者带来了新的希望。
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