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为探究铜绿假单胞菌 T6SS 进化及效应蛋白功能,研究人员分析其基因组,揭示多样特征与进化压力。
在微生物的世界里,细菌之间的生存竞争激烈程度丝毫不亚于宏观生物。为了在这场看不见硝烟的 “战争” 中胜出,许多细菌进化出了独特的 “武器”,其中,革兰氏阴性菌的 VI 型分泌系统(Type VI Secretion System,T6SS)便是一种强大的 “武器装备”。T6SS 能够将有毒的效应蛋白输送到与之竞争的细菌细胞内,从而抑制或杀死对方,在细菌的生存斗争中发挥着关键作用。
铜绿假<在微生物的微观世界中,细菌之间的 “生存大战” 时刻都在上演。为了在这场残酷的竞争中立足,革兰氏阴性菌进化出了一种强大的 “秘密武器”——vi 型分泌系统(t6ss)。t6ss 就像是细菌的>
铜绿假单胞菌作为研究 T6SS 的经典模式生物,一直是科研人员关注的焦点。它拥有三种独特的 T6SS,分别是 H1-T6SS、H2-T6SS 和 H3-T6SS,每个系统都能释放出一套特殊的 “毒素武器库”。然而,围绕着这些 T6SS,仍存在许多令人困惑的问题。为什么铜绿假单胞菌需要保留多个看似功能相近的 T6SS?是什么样的进化力量促使这些 T6SS 及其效应蛋白在物种内不断发生多样化?这些未解之谜就像一团团迷雾,阻碍着我们对细菌生存策略的深入理解,也激发了科研人员的探索热情。
为了揭开这些谜团,美国华盛顿大学的研究团队展开了深入研究,相关成果发表在《TRENDS IN Microbiology》杂志上。
研究人员主要采用了基因组分析和进化分析这两种关键技术。他们收集了来自世界各地不同环境的 1960 个高质量铜绿假单胞菌基因组,构建了庞大的研究样本库。通过基因组分析,详细解析这些基因组中 T6SS 基因的组成和特征;利用进化分析追溯 T6SS 基因的演化历程,探寻其进化规律。
研究发现,绝大多数(97%)的铜绿假单胞菌菌株都携带 H1-、H2- 和 H3-T6SS,这意味着这三种 T6SS 为铜绿假单胞菌在各种复杂环境中的生存提供了不可或缺的优势。不过,那 3% 不携带完整 T6SS 的菌株也别有乾坤。例如,从囊性纤维化患者肺部感染样本中分离出的一株菌,就缺失了 H1-T6SS。这一现象与某些拟杆菌在人体肠道长期定植过程中丢失 T6SS 基因的情况相似,暗示特定的生存环境可能会改变细菌对 T6SS 的依赖程度,进而影响其进化走向。此外,研究还意外发现了部分菌株携带第四种 T6SS——H4-T6SS。进化分析显示,H4-T6SS 经历了四次独立的获取事件,而且可能来源于不同的细菌,这表明特定的铜绿假单胞菌群体在适应特殊生态位的过程中,会积极 “吸纳” 新的 T6SS,以增强自身竞争力。
在效应蛋白方面,研究人员发现其可分为 “核心效应蛋白” 和 “辅助效应蛋白”。核心效应蛋白在几乎所有菌株中都稳定存在,它们或许在应对外来威胁时发挥着关键作用,相比种内竞争,对维持细菌的生存更为重要。同时,毒素的运输方式与其保守性存在关联,通过 Hcp 蛋白孔道运输的毒素更倾向于是核心效应蛋白。对于辅助效应蛋白呈现出的高度多样化,研究人员推测可能是铜绿假单胞菌菌株之间的 “内战”,或是与其他物种的 “军备竞赛” 所致。因为当其他物种进化出对抗特定毒素的防御机制时,铜绿假单胞菌就需要不断更新 “毒素武器”,以保持竞争优势。
将铜绿假单胞菌与其他细菌对比,会发现 T6SS 的进化模式在不同物种间差异巨大。副溶血性弧菌虽然也有四种 T6SS,但只有一种在大多数菌株中较为保守;而许多拟杆菌目的 T6SS 则像 “游牧民族” 一样,位于可移动遗传元件上,在不同菌株和物种之间频繁转移。这清晰地表明,不同的进化压力塑造了各异的 T6SS 格局。
这项研究成果意义非凡。它不仅让我们更深入地了解了铜绿假单胞菌 T6SS 的进化奥秘,也为研究细菌在复杂生态系统中的生存策略提供了重要线索。通过解析 T6SS 及其效应蛋白的进化规律,未来科研人员有望以此为基础,开发出更有效的抗菌策略,对抗由铜绿假单胞菌等引起的感染性疾病,为人类健康保驾护航。
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