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为解决班巴拉花生遗传改良难题,研究人员用 4399 个 SNP 标记研究其遗传多样性等,成果意义重大。
班巴拉花生(Bambara groundnut)是一种原产于非洲的耐旱豆类作物。在肯尼亚,这种作物由女性种植,但其种植品种的多样性尚不明确。由于缺乏关于该作物多样性和种群结构的信息,其遗传改良工作面临困难。本研究旨在:(i)利用 4399 个单核苷酸多态性(SNP)标记,确定来自肯尼亚的 86 个班巴拉花生品种的遗传多样性和种群结构;(ii)识别与班巴拉花生种子重量相关的 SNP 标记。研究采用了多样性阵列技术(DArT)复杂度降低方法结合 Illumina 短读长测序(HiSeq 2000)。种群结构分析表明存在三个遗传簇。除了来自基利菲(Kilifi)的品种明显归为同一簇外,来自同一县的品种被分到了不同的簇。分子方差分析显示,0.16% 的变异是由种群间的遗传分化造成的,19% 的变异源于种群内个体间的差异,81% 的变异存在于种群内个体中。研究发现,分布在班巴拉花生重叠群 1、2、3 和 5 上的由 DArTseq 衍生的 SNP 标记(
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