编辑推荐:
研究人员针对临床前生物医学研究综合分析的障碍开展研究,提出构建相关生态系统,加速生物医学转化。
在生物医学的世界里,如同拼图一般,每一项单独的研究成果都是一块碎片。然而,仅靠单一的研究 “碎片”,往往无法让我们看清整个生物医学领域的 “全貌”,难以做出有效的决策。比如在临床前生物医学研究中,各种研究成果纷繁复杂,有些甚至相互矛盾,就像一堆杂乱无章的拼图碎片,让人无从下手。
为了解决这些问题,来自柏林健康研究所(Berlin Institute of Health at Charité – Universit?tsmedizin Berlin)和爱丁堡大学医学院(The University of Edinburgh Medical School)的研究人员 Alexandra Bannach - Brown、Torsten Rackoll、Malcolm R. Macleod 和 Sarah K. McCann 等开展了相关研究,论文发表在《BMC Medical Research Methodology》上。
研究人员采用的主要关键技术方法包括对当前研究现状的系统梳理,分析证据合成过程中各个环节存在的问题;通过调研不同利益相关者在研究中的作用,提出改进的建议和措施;还对一些新兴工具和技术,如自动化工具、系统在线实时证据总结(SOLES)等进行评估和探讨。
研究结果如下:
当前研究系统与证据合成的障碍 :临床前研究中,原始证据多由独立实验室团队产生,与证据合成工作脱节,效率低下。系统评价的各步骤都面临诸多障碍,例如在系统检索和识别独特信息时,生物医学期刊众多,信息分散,研究设计关键信息报道不充分,检索质量受数据库访问权限影响,还存在重复发表问题;去除重复引用时,不同数据库元数据质量和格式差异大,自动化去重困难;链接相关信息时,预印本与最终发表版本的关联存在问题;获取全文和提取相关数据时,部分论文有访问限制,数据格式不统一,定量数据难以提取;获取原始数据时,原始数据很少公开,数据链接不规范,格式不统一且缺乏元数据;评估研究质量和偏差时,实验方案缺乏预注册和透明报告,导致选择性结果报告偏差和发表偏差,影响证据合成的准确性和时效性。
临床前研究做好综合分析的必备条件 :研究过程各阶段的实践都可优化以实现高效证据合成。在支持利于综合分析的研究和报告实践方面,研究设计方案和数据管理至关重要,提前注册研究方案能增强透明度和严谨性,资助者、期刊和出版商都应发挥作用。同时,遵循报告指南可提高研究报告质量,便于证据合成。建立研究基础设施和框架方面,数据存储库需要统一标准,提高数据的机器可读性和元数据质量。促进利于综合分析的出版和索引实践方面,研究论文等必须开放获取且机器可读,确保数据可用性和准确性,同时要建立研究制品之间的有效链接。此外,还需支持自动化,利用文本挖掘、机器学习等技术,但目前存在数据质量、工具验证等问题。
连接研究生态系统、未来方向和支持技术 :多方利益相关者的参与和协作对构建利于综合分析的生态系统至关重要。系统在线实时证据总结(SOLES)是加速证据合成的新兴工具,能为研究人员提供领域证据概述。然而,构建这样的生态系统面临挑战,如现有研究结构、个人激励机制、机构文化等,还需解决数据共享政策执行和人工智能带来的科学诚信问题。
研究结论和讨论部分强调,综合分析临床前证据对研究规划、临床转化、研究优先级设定以及医疗保健指南和政策制定具有重要意义。构建利于综合分析的实践应融入实验研究的设计、实施和报告中,同时要建立和优化支持综合分析的工具和基础设施。这需要多学科和多利益相关者的共同努力,以实现研究成果对社会成果的最大影响。这项研究为生物医学研究的发展指明了方向,有助于推动生物医学从基础研究到临床应用的快速转化,让研究成果更好地服务于人类健康。
打赏
下载安捷伦电子书《通过细胞代谢揭示新的药物靶点》探索如何通过代谢分析促进您的药物发现研究
10x Genomics新品Visium HD 开启单细胞分辨率的全转录组空间分析!
欢迎下载Twist《不断变化的CRISPR筛选格局》电子书
单细胞测序入门大讲堂 - 深入了解从第一个单细胞实验设计到数据质控与可视化解析
下载《细胞内蛋白质互作分析方法电子书》