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研究人员为揭示 circRNAs 在非小细胞肺癌(NSCLC)顺铂(DDP)耐药中的作用及临床应用,发现 hsa_circ_0006006 可作预后和耐药 biomarker,为诊疗提供新方向。
在肺癌的众多类型中,非小细胞肺癌(NSCLC)占据了主要地位,它包含腺癌、鳞癌和大细胞癌这三种主要亚型 。不同亚型的 NSCLC 在生物学行为和治疗反应上差异显著,患者的生存预后与肿瘤分期紧密相关,早期患者有望通过手术和辅助治疗治愈,而晚期患者的五年生存率却不到 10%。
在 NSCLC 的治疗手段里,以顺铂(DDP)为代表的铂类药物是标准治疗方案。然而,耐药问题却成了治疗路上的 “拦路虎”。目前已知的耐药机制十分复杂,涉及 DNA 修复、铂类药物的细胞外排、细胞凋亡抑制以及肿瘤微环境的改变等多个方面 。与此同时,寻找有效的诊断标志物、预测患者生存预后的指标以及克服 DDP 耐药的方法,在 NSCLC 的临床治疗中困难重重。虽然已经发现了像 EGFR 突变、ALK 融合基因这样的分子标志物,但它们在不同患者和肿瘤亚型中的表达差异很大,适用范围有限。而且现有的生物标志物在早期 NSCLC 诊断的敏感性和特异性上也有待提高。
为了突破这些困境,武汉大学同仁医院(武汉第三医院)、海军军医大学第一附属医院和西安市高陵区医院的研究人员展开了深入研究,相关成果发表在《Hereditas》上。
研究人员运用了多种关键技术方法。首先从 GEO 数据库提取数据进行生物信息分析,筛选差异表达的 circRNA;收集 31 例 NSCLC 患者、21 例 DDP 耐药 NSCLC 患者及 19 例健康受试者的血清样本;运用 RT-qPCR 检测关键 circRNA 表达;培养 A549 和 A549/DDP 细胞,进行细胞转染,用集落形成实验和流式细胞术验证 hsa_circ_0006006 对 DDP 耐药的影响;还通过绘制 ROC 曲线评估 circRNA 的诊断潜力 。
下面来看看具体的研究结果:
- NSCLC 中差异 circRNA 表达谱:通过对 GEO 数据库中 GSE112214 数据集分析,研究人员发现 NSCLC 组织中有 133 种 circRNA 低表达,15 种高表达 。GO 和 KEGG 分析显示,这些 circRNA 可能通过影响内质网 - 质膜接触位点(ER-PM contact sites)相关蛋白表达和蛋白丝氨酸 / 苏氨酸激酶活性,参与肿瘤发展。
- 关键 circRNA 的表达验证:对测序结果中表达差异显著的 circRNA 进行 RT-qPCR 验证,发现只有 hsa_circ_0006006、hsa_circ_0008234 和 hsa_circ_0006677 在 NSCLC 组织中有表达差异 。
- circRNA 与临床病理参数的关系:经卡方检验,hsa_circ_0006006 与 NSCLC 患者的 TNM 分期和淋巴结转移相关;hsa_circ_0008234 仅与 TNM 分期相关;hsa_circ_0006677 与患者临床病理特征无明显关联。
- circRNA 与患者生存预后的关系: Kaplan-Meier 法分析表明,hsa_circ_0006006 高表达的 NSCLC 患者生存预后较差,而 hsa_circ_0008234 和 hsa_circ_0006677 与患者生存预后无明显相关性。
- circRNA 的诊断价值:ROC 曲线分析显示,hsa_circ_0006006 能有效区分健康人和 NSCLC 患者,以及 DDP 耐药和敏感患者,具有较高的诊断效能。
- hsa_circ_0006006 的特性及功能验证:研究发现 hsa_circ_0006006 是一种稳定的 circRNA 。细胞实验表明,敲低 hsa_circ_0006006 可降低 A549/DDP 细胞的 DDP 耐药性,而过表达则增强耐药性。
综合研究结果和讨论部分,该研究揭示了 hsa_circ_0006006 在 NSCLC 中的重要作用 。它不仅与患者的生存预后、TNM 分期和淋巴结转移密切相关,还能作为诊断 NSCLC 和评估 DDP 耐药的潜在生物标志物。这一发现为 NSCLC 的早期诊断、预后评估和个性化治疗提供了新的靶点和方向,有助于开发针对性的小分子抑制剂或核酸药物,提升 NSCLC 的治疗效果。不过研究也存在一定局限性,如仅使用了一种 NSCLC 细胞系,未来还需进一步研究来验证结果的普适性 。但总体而言,该研究成果为 NSCLC 的诊疗开辟了新路径,具有重要的科学意义和临床应用潜力。
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