主要细胞类型:研究人员从 11 名患者的 BALF 中获得 121,409 个高质量细胞,并成功注释出五种主要细胞类型,即上皮细胞、增殖细胞、T 细胞、中性粒细胞和单核吞噬细胞。通过比较发现,CIP - S 组中单核吞噬细胞系统(MPs)细胞比例较高,CIP - M 组中 T 细胞和中性粒细胞比例较高,且这一结果得到了流式细胞术验证。
上皮细胞特征:在上皮细胞的进一步研究中,共注释出 13,129 个上皮细胞,并将其重新聚类为六个细胞簇,其中包括首次在 CIP 的 BALF 中发现的异常基底样细胞。CIP - S 组中异常基底样细胞和肺泡上皮细胞(AlveolarEpi)占比较高,且异常基底样细胞拷贝数变异较高,分化基因数量多。GO 分析显示 CIP - S 组 MHC II 类通路富集,其 MHC - II 表达评分更高。此外,异常基底样细胞的中性粒细胞趋化和趋化因子、细胞因子活性增强,SOX9 等转录因子在其调控网络中发挥重要作用。
中性粒细胞特点:对中性粒细胞重新聚类后得到四个亚群,CIP - S 组中性粒细胞的免疫激活相关通路更丰富,且 Neutrophil_CXCR2 亚群与 T 细胞激活等多种过程相关。基因集评分表明,CIP - S 组中性粒细胞的抗原呈递和促炎特征评分更高,促血管生成特征评分更低。同时,CIP - S 组患者外周血中性粒细胞比例和绝对值更高,淋巴细胞比例升高但绝对值无显著差异。
T 细胞和 MPs 亚型:T 细胞被注释为 4 个簇,CIP - S 组中 CD8+Teff 和 CD4+Treg 细胞富集,GO 和 KEGG 分析显示该组 T 细胞在激活和抗原处理等过程更活跃。MPs 进一步被注释为肥大细胞、巨噬细胞和单核细胞,CIP - S 组中巨噬细胞更丰富,其激活、T 细胞激活等相关过程在 GO 分析中显著富集。
细胞间通讯:通过分析发现,CD8+T 细胞和中性粒细胞是与异常基底样细胞相互作用最强的两种免疫细胞。CIP - S 组趋化因子通路增强,CXCL3/5 - CXCR2 等是主要的配体 - 受体对,推测异常基底样细胞通过这些途径激活免疫系统。