尿液细胞外囊泡 N - 糖组学:膀胱癌诊断的新希望

【字体: 时间:2025年03月08日 来源:Nature Communications

编辑推荐:

  为解决膀胱癌诊断难题,研究人员开展尿液细胞外囊泡(EVs)N - 糖组学研究,构建诊断模型,意义重大。

  膀胱癌是泌尿系统中最常见的恶性肿瘤,严重威胁着人们的健康。2022 年,全球约有 61.4 万新发病例,22 万人因此失去生命。目前,膀胱癌的诊断面临着诸多挑战。膀胱镜检查虽被视为诊断的 “金标准”,但它属于侵入性操作,会给患者带来极大的痛苦;尿液细胞学检查虽然无创,但其敏感性较低,尤其是对于低级别癌症的检测效果不佳;超声、CT 等影像学技术虽然有助于判断病变程度,但同样存在敏感性低的问题。此外,一些尿液衍生的标记物,如核基质蛋白 22(NMP22)、膀胱肿瘤抗原检测(BTA stat 和 BTA trak)等,虽然在一定程度上提高了诊断的敏感性,但仍无法满足临床需求,存在特异性低、受其他因素影响大等问题。因此,开发一种高效、无创的膀胱癌诊断方法迫在眉睫。
为了攻克这一难题,来自复旦大学附属闵行医院、海军军医大学第一附属医院等机构的研究人员开展了一项极具意义的研究。他们聚焦于尿液细胞外囊泡(EVs)的 N - 糖组学,试图从中找到膀胱癌诊断的新线索。相关研究成果发表在《Nature Communications》杂志上。

在研究过程中,研究人员运用了多种关键技术方法。他们收集了 333 名临床个体的尿液样本,这些样本来自上海长海医院泌尿外科。通过 EVTrap 磁珠从 1mL 尿液中分离出 EVs,该方法相较于传统方法,操作更简便、效率更高,适合大规模队列研究。随后,利用基于 96 孔板的高通量样本制备方法富集 N - 糖,并采用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)获取 N - 糖组数据。此外,还运用了机器学习技术构建诊断模型,并通过蛋白质组学等方法对相关机制进行深入探究。

研究结果主要包括以下几个方面:

  1. 患者、样本收集和研究设计:研究人员收集了 333 名个体的尿液样本,分为发现队列和两个独立的验证队列。在发现队列中,对 132 名个体进行 N - 糖候选标记物筛选,随后在验证队列 1(n=83)和验证队列 2(n=118)中对诊断模型进行验证。通过一系列操作,共鉴定出 252 种 N - 糖,并生成了尿液 EVs 的综合 N - 糖组图谱12
  2. EVs 的表征和质量控制:对分离出的 EVs 进行纳米颗粒跟踪分析(NTA)、蛋白质免疫印迹(WB)和透射电子显微镜(TEM)表征,结果显示所分离的尿液 EVs 纯度高、质量好,适合后续分析。同时,通过对质量控制(QC)样本的分析,证明了实验仪器的高稳定性和实验流程的可靠性34
  3. 尿液 EVs 中 N - 糖组谱的综合分析:研究发现,膀胱癌患者尿液 EVs 中的 N - 糖组存在显著变化。与健康对照组相比,膀胱癌患者尿液 EVs 中高分支和岩藻糖基化的 N - 糖水平降低,而唾液酸水平升高。此外,还鉴定出 8 种 N - 糖作为候选诊断标记物,这些标记物均为复杂或混合型,且 75% 含有唾液酸56
  4. 膀胱癌诊断模型的开发和评估:基于 8 种候选生物标志物,利用机器学习技术构建诊断模型。通过比较 9 种不同机器学习算法的性能,最终选择逻辑回归模型构建最终诊断模型。该模型在两个验证队列中表现出色,受试者工作特征曲线下面积(ROC AUC)分别达到 0.88 和 0.86,能够有效区分膀胱癌患者和健康个体,并且对非肌层浸润性膀胱癌(NMIBC)和肌层浸润性膀胱癌(MIBC)也有较好的区分能力78
  5. 携带癌症相关 N - 糖特征的 EV 糖蛋白的综合表征:对尿液 EVs 进行 N - 糖蛋白质组学分析,共鉴定出 7787 种糖型。通过分析发现,携带癌症相关 N - 糖特征的 EV 糖蛋白(EVcans)与免疫活动密切相关,KEGG 和 GO 富集分析表明这些蛋白参与免疫调节、补体激活等过程910
  6. 尿液 EVs 和组织 N - 糖组的成对比较分析:对膀胱癌患者的肿瘤组织、癌旁正常组织和尿液 EVs 进行 N - 糖组分析,发现肿瘤组织和癌旁正常组织的 N - 糖组存在显著差异,且尿液 EVs 与组织的 N - 糖组也有明显不同,如尿液 EVs 中的唾液酸化水平显著高于癌组织1112
  7. 膀胱癌细胞系及其衍生 EVs 的 N - 糖组差异分析:对五种膀胱细胞系及其衍生的 EVs 进行 N - 糖组学分析,发现 EVs 和其来源细胞的 N - 糖组既有相似之处,也存在显著差异。例如,EVs 中复杂或混合型 N - 糖的比例增加,唾液酸化水平显著升高,而高甘露糖型 N - 糖的比例降低1314

研究结论和讨论部分指出,该研究成功开发了一种基于尿液 EVs 的 N - 糖组分析的膀胱癌诊断模型,为临床膀胱癌筛查提供了新的方法和思路。同时,研究还揭示了膀胱癌患者尿液 EVs 中 N - 糖组的变化规律,以及这些变化与疾病发生、发展的潜在关系。不过,目前该模型在区分膀胱癌患者与良性泌尿系统疾病(UB)和其他泌尿系统恶性肿瘤(UM)患者方面的性能还有待提高,未来可通过整合临床特征或其他诊断方法来进一步增强其预测能力。总的来说,这项研究为膀胱癌的诊断和治疗开辟了新的方向,具有重要的临床意义和研究价值,有望为膀胱癌患者带来新的希望。

婵犵數鍋為崹鍫曞箰閹间緡鏁勯柛顐g贩瑜版帒鐐婇柍瑙勫劤娴滈箖鏌i悢鐓庝喊婵℃彃婀遍埀顒冾潐閹稿摜鈧稈鏅濋埀顒勬涧閵堟悂寮崒鐐村€锋い鎺嶇劍閻﹀酣姊虹拠鎻掝劉缂佸甯″畷婵嬪箳濡も偓缁€澶愭煟閺冨倸甯舵潻婵囩節閻㈤潧孝婵炶尙濞€瀹曟垿骞橀幇浣瑰兊閻庤娲栧ú銊╂偩閾忓湱纾介柛灞剧懅椤︼附淇婇锝囩煉鐎规洘娲熼、鏃堝川椤栵絾绁梻浣瑰缁诲倿鎮ч幘婢勭喓鈧綆鍠楅悡娆愮箾閼奸鍤欐鐐达耿閺屾洟宕堕妸銉ユ懙閻庢鍣崜鐔肩嵁瀹ュ鏁婇柣锝呮湰濞堟悂姊绘担钘変汗闁烩剝妫冨畷褰掓惞椤愶絾鐝烽梺绉嗗嫷娈曟い銉ョ墦閺屾盯骞橀懠顒夋М婵炲濯崹鍫曞蓟閺囥垹骞㈡俊銈咃工閸撻亶鏌i姀鈺佺仭濠㈢懓妫楀嵄闁圭増婢橀~鍛存煟濞嗗苯浜惧┑鐐茬湴閸婃洟婀侀梺鎸庣箓濡瑧绮堢€n喗鐓冪憸婊堝礈濮橆厾鈹嶉柧蹇氼潐瀹曟煡鏌涢幇銊︽珖妞も晝鍏橀弻銊モ攽閸℃瑥鈪靛┑鈽嗗灠椤戝寮诲☉銏犵闁瑰鍎愬Λ锟犳⒑鐠囧弶鍞夊┑顔哄€楃划姘舵焼瀹ュ懐顦ㄥ銈嗘尵婵兘顢欓幒妤佲拺閻犲洠鈧櫕鐏侀梺鍛婃煥妤犳悂鍩㈤幘璇茬闁挎棁妫勫▓銉ヮ渻閵堝棛澧紒顔肩焸閸╂盯寮介鐔哄幈濠电偛妫欓崝鏇㈡倶閳哄偆娈介柣鎰级閸犳﹢鏌熼姘毙х€殿噮鍣e畷鎺懳旀担瑙勭彃

10x Genomics闂傚倷绀侀幖顐﹀磹閻熼偊鐔嗘慨妞诲亾妤犵偞鐗犻垾鏂裤€掓刊鐖剈m HD 闂佽瀛╅鏍窗閹烘纾婚柟鍓х帛閻撴洘鎱ㄥΟ鐓庡付闁诲繒濮烽埀顒冾潐濞叉粓宕伴幘鑸殿潟闁圭儤顨呴獮銏℃叏濮楀棗澧┑顔煎暣濮婃椽宕ㄦ繝鍌滅懆濠碘槅鍋呯划宥夊Φ閺冨牆绠瑰ù锝囨嚀娴犮垽姊洪幖鐐插姉闁哄懏绮撻幃楣冩焼瀹ュ棛鍘遍棅顐㈡搐椤戝懏鎱ㄩ埀顒€鈹戦悙瀛樼稇婵☆偅绮撴俊鐢稿箛閺夊灝宓嗛梺缁樶缚閺佹悂鎮℃担铏圭=濞达絽鎲″﹢鐗堜繆閻愯埖顥夐摶鐐烘煕瑜庨〃鍛矆閸℃稒鐓曢柍鈺佸暈缂傛岸鏌嶈閸忔稓鍒掑▎鎾虫瀬鐎广儱顦伴弲鎼佹煥閻曞倹瀚�

濠电姷鏁搁崑娑樜涙惔銊ュ瀭闁兼祴鏅滃畷鏌ユ倵閿濆骸浜為柍缁樻閹鏁愭惔鈥崇缂備椒鑳跺▍澧俰st闂傚倷绶氬ḿ褍螞濡ゅ懏鏅濋柨婵嗘川缁犳柨顭块懜闈涘婵☆偅蓱閵囧嫰骞樼捄杞扮捕缂傚倸绉崇欢姘跺蓟濞戙垹鍐€闁靛ě鍐f嫛婵犵數鍋涢悧濠囧储椤ョSPR缂傚倸鍊烽悞锔剧矙閹烘鍎庢い鏍仜閻掑灚銇勯幒鍡椾壕濡炪倧缂氶崡鎶藉箖瑜斿畷顐﹀Ψ閵堝棗濯伴梻渚€鈧偛鑻晶鏉戔攽閳ユ剚鍤熼柍褜鍓ㄧ紞鍡涘礈濮樿泛姹查柍鍝勬噺閸婂灚绻涢幋鐐垫噧濠殿喖鍟撮弻娑㈠籍閹炬潙顏�

闂傚倷绀侀幉锟犮€冮崱妞曞搫饪伴崨顓炵亰闂婎偄娲︾粙鎺楀吹閸曨垱鐓熼柟閭﹀墻閸ょ喖鏌曢崼鐔稿唉妤犵偞鐗犲鍫曞箣閻樻鍞堕梻浣告啞閻熴儱螞濠靛棭娼栧┑鐘宠壘鎯熼梺闈涱檧缁茬厧霉閻戣姤鐓熼柣妯夸含閸斿秶鎲搁弶鍨殻闁诡喓鍎甸弫鎾绘晸閿燂拷 - 濠电姷鏁搁崕鎴犲緤閽樺鏆︽い鎺戝閻鏌涢埄鍐$細妞も晜鐓¢弻娑㈠焺閸愭儳姣€闂佸湱鍎ら幐楣冦€呴悜钘夌閺夊牆澧界粔鐢告煕鎼淬垹鐏ラ柍钘夘樀楠炴﹢顢涘顐㈩棜婵犵數鍋為崹鍫曞箹閳哄倻顩叉繝濠傚暟閺嗭箓鏌i弮鍥仩缁炬儳銈搁弻娑㈠焺閸愵厼顥濋梺鍛婃⒐鐢繝骞冨Δ鍛嵍妞ゆ挾鍋樺Σ鎰版⒑缂佹ḿ鈯曢柣鐔濆洤绠悗锝庡枛缁犳煡鏌熸导瀛樻锭闁诡喕绶氬娲川婵犲倻顑傛繝鈷€鍕垫疁鐎殿喗濞婇幃銏ゆ偂鎼达綆鍞规俊鐐€栭弻銊╂倶濠靛牏鐜绘繛鎴欏灪閻撴瑩鎮归妸銉Ц闁稿﹤顭烽幃鐑藉閵堝棛鍘卞┑鐐叉閿氶柣蹇嬪劜閵囧嫰顢曢姀鈺佸壎閻庤娲滄繛鈧€殿喕绮欓、鏍敃閿濆懏璇為悗娈垮枟閹倿寮幘缁樻櫢闁跨噦鎷�

婵犵數鍋為崹鍫曞箰閹间緡鏁勯柛顐g贩瑜版帒鐐婃い鎺嗗亾鏉╂繃绻濋悽闈浶㈤悗姘煎櫍閹本鎯旈妸锔惧幘閻庤娲栧ú銈嗙濠婂牊鐓曢柣鎰摠鐏忥箓鏌熼挊澶娾偓濠氬焵椤掑﹦绉甸柛鎾村哺椤㈡棃濡舵径瀣化闂佽澹嬮弲娑欎繆閾忓湱纾奸柕濞у喚鏆梺鐟板槻閹冲酣銈导鏉戠闁靛ě鈧崑鎾寸節濮橆厾鍘搁柣搴秵閸嬪嫭鎱ㄩ崼銉︾厸鐎光偓閳ь剟宕版惔銊ョ厺闁哄啫鐗嗛崡鎶芥煟濡寧鐝慨锝呭閺岋絾鎯旈姀鈶╁闂佸憡姊圭敮鈥崇暦濠靛鍋勯柣鎾冲閵夆晜鐓ラ柣鏇炲€圭€氾拷

相关新闻
生物通微信公众号
微信
新浪微博
  • 急聘职位
  • 高薪职位

知名企业招聘

今日动态 | 人才市场 | 新技术专栏 | 中国科学人 | 云展台 | BioHot | 云讲堂直播 | 会展中心 | 特价专栏 | 技术快讯 | 免费试用

版权所有 生物通

Copyright© eBiotrade.com, All Rights Reserved

联系信箱:

粤ICP备09063491号