靶向致癌 RAS 诱导的非经典自噬:癌症治疗新希望

【字体: 时间:2025年03月08日 来源:Cell Research 28.2

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  为探究 RAS 突变癌症中自噬调控差异,研究人员开展相关研究,发现 RINCAA,为治疗提供新靶点。

  

在人体的微观世界里,细胞时刻进行着各种精细的活动,其中自噬(Macroautophagy)就像是细胞的 “清道夫”,负责清理受损的细胞器、入侵的细菌和易聚集的蛋白质,维持着细胞的内环境稳定。然而,在癌症的阴影下,自噬却变得异常复杂。特别是在携带 RAS 突变的癌细胞中,自噬被异常激活,成为癌细胞增殖和存活的帮凶,这让它成为了极具潜力的癌症治疗靶点。但目前,RAS 诱导的自噬与正常生理状态下的自噬,在调控机制上究竟有何不同,仍然是一个未解之谜,这也使得开发针对癌症的特异性抗自噬疗法困难重重。

为了攻克这一难题,来自清华大学、广州医科大学等机构的研究人员展开了深入研究。他们的研究成果发表在《Cell Research》杂志上,为 RAS 突变癌症的治疗带来了新的曙光。


研究人员采用了多种致癌 RAS 诱导的自噬模型,通过一系列实验深入探究了癌症中自噬失调的潜在分子机制。他们发现,KRAS(G12V)会诱导一种非经典自噬,其特征是 ATG8ylation,且该过程不依赖于一些在饥饿诱导自噬中常见的自噬因子,如 III 类 PI3K、ATG9A 和 ATG2,研究人员将其命名为 RAS 诱导的非经典自噬(RAS-induced non-canonical autophagy via ATG8ylation,RINCAA)。在 RINCAA 过程中,形成的是具有多囊泡和多层结构的非经典自噬体,被 ATG8 家族蛋白(如 LC3 和 GABARAP)标记,研究人员将这些结构称为 RAS 诱导的 ATG8ylation 多囊泡 / 多层体(RAS-induced multivesicular/multilaminar bodies of ATG8ylation,RIMMBA)。


研究人员还发现了一条关键的调控信号级联 P38-ULK1-PI4KB-WIPI2。其中,P38 激活 ULK1,ULK1 磷酸化 PI4KB 的 S256 和 T263 位点,激活 PI4KB 产生 PI4P,WIPI2 作为 PI4P 的效应器,进一步促进非经典自噬膜的形成。


为了开展这项研究,研究人员运用了多种技术方法。在细胞实验方面,构建了多种细胞模型,如稳定表达 Flag-KRAS(G12V)的 HEK293T 细胞等;通过基因敲低技术,研究关键自噬因子的作用;利用免疫荧光、免疫印迹等方法检测蛋白表达和细胞自噬水平。在动物实验方面,使用了裸鼠和 KPC 小鼠等动物模型,进行皮下异种移植瘤实验,观察肿瘤生长情况 。


具体来看研究结果:


  • 建立细胞系统分析 KRAS 诱导的自噬:研究人员构建了可诱导表达 KRAS(G12V)的 HEK293T 细胞系,通过多种实验方法,如检测脂化 LC3(LC3-II)水平、观察 LC3 puncta 数量、利用双荧光 LC3 报告系统等,证实了 KRAS(G12V)能够激活自噬并增强自噬通量。同时,通过抑制剂实验和基因敲低实验,进一步验证了 KRAS 激活与自噬上调之间的关系。

  • KRAS(G12V)和饥饿诱导自噬中自噬因子的异同:研究人员利用基因敲低技术,对参与饥饿诱导自噬的关键自噬因子进行研究。结果发现,RAS 诱导的自噬(RINCAA)与饥饿诱导自噬既存在共享的自噬因子,也有不同的自噬因子。例如,PI3K 复合物、ATG9A 和 ATG2 对饥饿诱导自噬至关重要,但在 RINCAA 中却并非必需;而脂质转移蛋白 VPS13B 在 RINCAA 中不可或缺。此外,RINCAA 形成的是 RIMMBA,与饥饿诱导自噬产生的双膜自噬体不同。

  • PI4KB 调节 RINCAA:由于 RINCAA 不依赖 PI3K,研究人员推测可能有其他 PI 激酶发挥作用。通过抑制剂实验和基因敲低实验,发现 PI4KB 是 RINCAA 的主要调节因子。PI4KB 通过产生 PI4P,替代了经典 PI3K 在 RINCAA 中的功能。抑制 PI4KB 会减少肿瘤细胞的自噬和增殖,且该策略与 MEK 抑制剂联合使用可增强抑瘤效果。

  • WIPI2 在 RINCAA 中作为 PI4P 效应器:研究表明 WIPI2 在 RINCAA 中定位于 RIMMBA,且其定位依赖于 PI4P。通过一系列实验,如免疫荧光、膜分离实验、脂质浮选实验等,证实了 WIPI2 与 PI4P 的结合能力更强,是 RINCAA 中的 PI4P 效应器,而 ATG9A 和 ATG2 不参与 PI4P 的产生和 WIPI2 puncta 的形成。

  • P38-ULK1-PI4KB-WIPI2 级联调节 RINCAA:研究人员通过抑制剂实验,发现 P38 通路参与 RINCAA 的调节。P38 激活 ULK1,ULK1 磷酸化激活 PI4P 的生物合成,并促进 WIPI2 靶向早期 RIMMBA 结构。进一步研究发现,ULK1 介导的 PI4KB 磷酸化对 RINCAA 和 KRAS 突变肿瘤的生长至关重要,抑制该磷酸化可抑制肿瘤生长。

  • ULK1 调节的 PI4KB 磷酸化可能是治疗 RAS 突变癌症的靶点:研究发现,RAS 突变的癌细胞和结直肠癌标本中,PI4KB 在 S256 和 T263 位点的磷酸化水平较高。通过多种实验,如体内外实验、肿瘤异种移植实验等,证实了靶向 PI4KB 在 S256 和 T263 位点的磷酸化,能够特异性抑制 RAS 突变肿瘤中的 RINCAA,抑制肿瘤生长,且效果优于传统的自噬抑制剂氯喹。在免疫功能正常的小鼠中,PI4KB-Peptide-1 的抑瘤效果更显著,这表明其可能通过增强免疫反应来抑制肿瘤。


研究结论和讨论部分指出,该研究揭示了一种由致癌 KRAS 诱导的非经典自噬 RINCAA 的调控机制,明确了 P38-ULK1-PI4KB 轴在其中的关键作用。这一发现不仅丰富了人们对自噬在不同疾病状态下调控机制的理解,更为 RAS 突变癌症的治疗提供了新的潜在靶点和治疗策略。PI4KB 在 S256 和 T263 位点的磷酸化有望成为治疗 RAS 突变癌症的特异性靶点,未来进一步开发针对该靶点的小分子抑制剂,可能会为癌症治疗带来新的突破。

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