泰国东北部低地四族群的遗传密码：α- 珠蛋白基因与 VNTR 多态性探秘

为探究老挝、高棉、克依和耶尔族遗传背景，研究人员分析 α- 珠蛋白基因簇及 VNTR 位点，揭示遗传变异与族群关系。

　　在泰国东北部的低地地区，生活着老挝、高棉、克依和耶尔等多个族群，这里就像是一个民族文化与遗传基因的 “大熔炉”。然而，长期以来，一个困扰科学界的问题是，这些族群中 α⁺- 地中海贫血（α⁺-thalassemia）的患病率极高，但背后的遗传背景却如同迷雾一般，让人捉摸不透。α⁺- 地中海贫血是一种由于珠蛋白基因异常导致的遗传性血液疾病，患者的血红蛋白合成受到影响，进而引发一系列健康问题。了解其遗传背景，对于疾病的预防、诊断和治疗至关重要，同时也有助于揭示这些族群的遗传起源和相互关系。

为了揭开这层神秘的面纱，来自泰国多所大学的研究人员，包括 Burapha University、Srinakharinwirot University、Ubon Ratchathani University 和 Khon Kaen University 等，开展了一项深入的研究。他们的研究成果发表在《Scientific Reports》上，为我们理解这些族群的遗传奥秘提供了重要线索。

研究人员主要采用了以下几种关键技术方法：首先，从 542 名来自不同族群的受试者中采集血液样本，这些受试者均为健康个体，且至少三代属于研究族群，无其他族群混血情况。接着，使用 GF1 - 血液 DNA 提取试剂盒从外周血白细胞中提取 DNA。对于 α⁺- 地中海贫血基因的鉴定，采用缺口聚合酶链反应（gap-PCR）方法检测常见的 α- 地中海贫血基因（-α^3.7和 -α^4.2），并通过等位基因特异性 PCR 方法鉴定 Hb Constant Spring（Hb CS；HBA2:c.427T > C）和 Hb Pakse（HBA2: c.429 A > T）。对于 α- 珠蛋白基因单倍型分析，选取了 342 名受试者（110 名正常 α- 珠蛋白基因型和 232 名 α⁺- 地中海贫血患者），利用 PCR-RFLP 技术分析 α- 珠蛋白基因簇中的 6 个多态性位点。在 VNTR 位点（D1S80、D17S5 和 TPO）分析方面，对 447 名受试者的 DNA 样本，采用基于 PCR 的方法检测等位基因频率 ，同时还纳入了泰国、老挝和柬埔寨的部分样本进行对比。

研究结果如下：

• α- 珠蛋白基因单倍型分析：对 342 名受试者的 α- 珠蛋白基因单倍型进行分析，共成功分离出 419 条染色体。研究发现，不同族群中与（αα）、（-α^3.7）、（α^CSα）和（α^PSα）相关的单倍型模式存在差异。例如，老挝族群中与（-α^3.7）相关的最常见单倍型为框架 1 的（+M - + ? 0），而高棉和克依族群则为框架 2 的（+S - + ? 0），耶尔族群为框架 2 的（-S - - ? 0） 。与（α^CSα）相关的单倍型在不同族群中也有所不同，且某些单倍型在特定族群中具有局限性。此外，（α^PSα）基因存在多起源现象，其相关单倍型在不同族群中的分布也有所差异。
• VNTR 位点分析：D1S80、D17S5 和 TPO VNTR 位点的等位基因频率分布显示，这些族群的遗传变异广泛，且与其他已报道的人群存在差异。多数等位基因在研究的族群以及泰国、柬埔寨和老挝人群中均有观察到，但不同族群中最常见的等位基因有所不同 。在观察杂合度方面，多数 VNTR 位点的观察杂合度与预期杂合度存在显著差异，仅克依族群的 D17S5 和 TPO 位点无显著差异。
• 族群关系分析：基于 D17S5 VNTR 位点的系统发育树分析表明，高棉和克依族群关系密切，与说泰 - 卡岱语系的老挝族群距离较远，同时耶尔和克依族群之间也存在一定的族群关系 。然而，基于 D1S80 和 TPO VNTR 位点的系统发育树分析结果并不一致。
• 多变量分析：多变量分析显示，多数遗传决定因素之间无显著关系，但在 α⁺- 地中海贫血组中，发现 D1S80 等位基因与 I（inter-ζ-HVR 多态性）之间存在显著关系。

研究结论与讨论：
这项研究首次对泰国东北部低地的老挝、高棉、克依和耶尔族群的 α- 珠蛋白基因簇和三个 VNTR 位点进行了遗传变异分析。研究结果揭示了这些族群的遗传差异和变异，为深入理解 α⁺- 地中海贫血基因在这些族群中的遗传背景提供了重要依据。例如，不同族群中 α- 珠蛋白基因单倍型的差异，以及（α^PSα）基因的多起源现象，都有助于解释为何 α⁺- 地中海贫血在这些族群中的分布存在差异。同时，通过 VNTR 位点分析发现的遗传变异和族群关系，也为研究这些族群的遗传起源和迁徙历史提供了线索。

然而，研究也存在一定的局限性。由于系统发育分析的方法和假设是基于存在问题的中性理论和分子钟假设，因此研究结果的解释应保持谨慎。未来的研究需要探索更合适的模型，如最大遗传多样性理论，以更好地解释遗传变异的复杂性，这将有助于更准确地揭示这些族群中地中海贫血、疟疾抗性及其他相关性状的遗传基础，为相关疾病的防控和族群遗传研究提供更坚实的理论支持。