NAT10 介导的 mRNA 中 ac4C 修饰在 T 细胞免疫中的关键作用及机制

【字体: 时间:2025年03月06日 来源:Nature Immunology 27.8

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  为探究 T 细胞激活和增殖机制,研究人员聚焦 NAT10 介导的 ac4C 修饰,发现其对 T 细胞功能至关重要,为免疫治疗提供新靶点。

  

在人体的免疫系统中,T 细胞就像一群训练有素的 “卫士”,时刻守护着身体的健康。当遇到病原体入侵时,初始 T(TN)细胞会迅速响应,通过快速的克隆扩增和分化,来执行高效的免疫反应。然而,这一过程背后的具体机制却一直是个谜。目前,虽然已经发现了超过 170 种核糖核苷酸修饰,但 N4- 乙酰胞苷(ac4C)这种在 RNA 中唯一被观察到的乙酰化标记,在哺乳动物 T 细胞中的生理作用仍然未知。解开 T 细胞扩张的机制,对于理解免疫反应的调节以及免疫功能障碍至关重要,基于此,来自复旦大学附属中山医院、安徽医科大学第一附属医院等机构的研究人员展开了相关研究,其研究成果发表在《Nature Immunology》上。

研究人员采用了多种关键技术方法来开展研究。在样本获取方面,使用了人类外周血单个核细胞(PBMCs)以及多种小鼠品系的细胞和组织样本 。通过 RNA 测序(RNA-seq)、乙酰化 RNA 免疫沉淀测序(acRIP-seq)、核糖体分析(Ribo-seq)等技术,从转录组和翻译组水平对基因表达和修饰进行分析;利用基因编辑技术构建了 Nat10 条件性敲除(CKO)小鼠模型;借助流式细胞术(FCM)对细胞的表型、增殖、凋亡等进行检测 。


研究结果如下:


  • NAT10 在 T 细胞激活过程中上调:研究发现,在 T 细胞激活过程中,NAT10 的表达会显著增加。通过体外实验,用抗 CD3/CD28 刺激小鼠脾 TN细胞,发现 NAT10 蛋白表达在 6、24 和 48 小时显著上升;在体内实验中,利用急性淋巴细胞性脉络丛脑膜炎病毒(LCMV)感染小鼠模型,也证实了 T 细胞中的 NAT10 会随着病毒感染和清除而响应激活。进一步研究发现,T 细胞受体(TCR)信号通过 c-JUN 激活 NAT10 介导的 ac4C 修饰过程12

  • NAT10 对维持 T 细胞库至关重要:构建 Nat10 T 细胞 - CKO 小鼠后发现,CKO 小鼠的 T 细胞中 NAT10 表达和 ac4C 水平降低。单细胞 RNA 测序(scRNA-seq)和流式细胞术分析表明,Nat10 的缺失主要影响脾 T 细胞的发育,导致 T 细胞池显著缩小,且多种 T 细胞标记物表达下调3

  • NAT10 缺失导致 T 细胞增殖受损和凋亡增加:体内外增殖实验显示,CKO T 细胞的增殖能力明显受损,细胞周期停滞在 G0 - G1 期,同时凋亡增加。这表明 NAT10 在调节 T 细胞增殖和维持细胞存活方面起着关键作用4

  • NAT10 对 Myc mRNA 的稳定性和翻译至关重要:通过 RNA-seq 和 acRIP-seq 分析,发现 NAT10 缺失会导致 Myc mRNA 的 ac4C 修饰水平降低,进而影响其稳定性和翻译效率,使 MYC 蛋白表达减少。而 MYC 是 T 细胞增殖的关键蛋白,这揭示了 NAT10 影响 T 细胞功能的重要分子机制56

  • Nat10 缺失导致 T 细胞代谢功能障碍:研究发现,除了直接影响 MYC 相关代谢基因集的转录水平,NAT10 缺失还会导致 T 细胞的代谢功能广泛受损,包括核苷酸、脂质、碳水化合物、氨基酸和能量代谢等方面,无法为 T 细胞的激活和增殖提供足够的能量和物质支持78

  • NAT10 过表达可挽救 CKO T 细胞的增殖缺陷:构建骨髓嵌合小鼠模型,在 CKO 造血干细胞(HSCs)中过表达 NAT10 或 MYC,结果显示能够有效恢复 T 细胞池的大小和 T 细胞的增殖能力,证明了 NAT10 - MYC 轴在维持 T 细胞功能中的关键作用910

  • NAT10 在 T 细胞抗病毒免疫中起重要作用:通过 LCMV 感染 FLOX 和 CKO 小鼠模型发现,NAT10 缺失会导致 T 细胞的抗病毒能力严重受损,病毒载量增加,淋巴细胞增殖减弱,病毒特异性 T 细胞比例和功能下降,同时影响记忆 T 细胞的形成1112

  • 老年人 T 细胞中 NAT10 水平降低与年龄相关的抗病毒缺陷有关:研究发现,在小鼠和人类中,随着年龄的增长,T 细胞中 NAT10 的表达水平会下降,这与 T 细胞的增殖缺陷和抗病毒反应受损相关。对 COVID-19 患者的数据分析也表明,NAT10 表达与疾病严重程度呈负相关1314

  • NAT10 过表达可恢复老年人 T 细胞的增殖和抗病毒缺陷:在老年小鼠的 T 细胞中过表达 NAT10 或 MYC,能够改善 T 细胞的增殖和代谢缺陷,提高其抗病毒能力。这表明 NAT10 有望成为免疫治疗的新靶点,尤其是针对老年人的免疫治疗1516


综上所述,该研究揭示了 NAT10 介导的 ac4C 修饰在 T 细胞激活、增殖和抗病毒免疫中的关键作用机制。NAT10 通过对 Myc mRNA 的 ac4C 修饰,促进 MYC 蛋白的合成,进而推动 T 细胞的增殖和代谢,维持 T 细胞的抗病毒免疫功能。此外,研究还发现 NAT10 的表达与年龄相关的 T 细胞功能衰退以及 COVID-19 的疾病严重程度密切相关,为深入理解免疫衰老和开发新的免疫治疗策略提供了重要依据。不过,该研究也存在一些局限性,比如 T 细胞在缺乏 NAT10 时变得过度活跃的原因尚不明确,NAT10 在疾病背景下对 T 细胞的调节机制也有待进一步研究。未来,还需要更多的研究来深入探索这些问题,以更好地理解 T 细胞免疫的调控机制,为相关疾病的治疗提供更有效的靶点和策略。

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