编辑推荐:
为探究 IRF8 在硬骨鱼中的功能,研究人员鉴定鲤鱼 IRF8 基因,发现其在免疫中作用关键,助力鱼类疾病防控。
在奇妙的生物世界里,鱼类作为水生生物的重要代表,其健康生长关乎着水产养殖业的兴衰。然而,鱼类在养殖过程中常常遭受各种病毒和细菌的侵袭,就像鲤鱼,这种在中国及欧亚部分国家重要的淡水养殖鱼类,也难以幸免。鱼类的适应性免疫系统相较于高等脊椎动物并不发达,因此,先天免疫系统在鱼类抵御病原体入侵时发挥着至关重要的作用(先天免疫系统:是生物体在长期进化过程中形成的固有免疫防御体系,能对病原体做出快速、非特异性的免疫反应)。
干扰素调节因子(Interferon regulatory factors,IRF)家族在动物先天免疫中扮演着核心角色,其中 IRF8 在哺乳动物的先天和适应性免疫系统里都有着举足轻重的地位。在鱼类中,虽然已有部分关于 IRF8 的研究,但对于它在鱼类免疫系统中的调控作用,仍存在诸多未知。为了深入了解鱼类免疫防御的机制,更好地预防和控制鲤鱼养殖过程中的疾病,海南热带海洋大学和山东师范大学的研究人员展开了一项关于鲤鱼 IRF8 基因(ccIRF8)的研究,该研究成果发表在《BMC Veterinary Research》上。
研究人员为了开展此项研究,运用了多种关键技术方法。首先,通过从济南当地渔场获取健康鲤鱼,构建了实验样本队列。然后利用密度梯度离心法分离鲤鱼头肾白细胞(HKLs) 。在基因研究方面,运用实时荧光定量 PCR 技术,对基因表达水平进行精准检测;采用序列分析技术,探究 ccIRF8 的基因结构和进化关系;构建过表达载体,来研究 ccIRF8 对相关信号通路的调控作用。
研究结果如下:
- ccIRF8 的分子特征:研究人员成功克隆出 ccIRF8 的全长 cDNA 序列,其长度为 1431bp,编码 423 个氨基酸。通过分析发现,ccIRF8 具有 IRF 家族典型的结构,包含 DNA 结合域(DBD)、IRF 关联域(IAD)以及两个核定位信号(NLS)。序列比对显示,ccIRF8 与草鱼 IRF8 的序列一致性最高,达到 92.7%。系统发育分析表明,ccIRF8 与其他硬骨鱼的 IRF8 聚为一支。
- 组织分布:研究发现 ccIRF8 在鲤鱼的各个组织中均有表达,其中在脾脏中的表达量最高,这暗示着它可能在鱼类系统免疫中发挥着重要作用。
- 免疫刺激后的表达变化:在给鲤鱼腹腔注射多聚肌苷酸 - 聚胞苷酸(poly I:C)和嗜水气单胞菌后,研究人员发现 ccIRF8 在免疫相关组织中的表达显著上调。在体外实验中,用 poly I:C、脂多糖(LPS)、肽聚糖(PGN)和鞭毛蛋白刺激 HKLs,ccIRF8 的表达也会被诱导,这进一步证实了它在免疫反应中的重要性。
- ccIRF8 对细胞因子的影响:在 EPC 细胞中过表达 ccIRF8 后,研究人员检测到 IFN、PKR、Viperin、ISG15、TNFα 和 IL - 1β 等基因的表达水平显著增加,表明 ccIRF8 对 IFN 信号通路具有正调控作用。
- ccIRF8 对 NF-κB 激活的影响:双荧光素酶报告基因实验显示,ccIRF8 不能激活 NF-κB,并且会抑制由 TRAF6 介导的 NF-κB 信号通路,说明 ccIRF8 在 NF-κB 信号通路中起负调控作用。
综合研究结论和讨论部分,该研究首次克隆了鲤鱼的 ccIRF8 基因,发现其在病原体入侵后,在免疫相关组织和 HKLs 中的表达会显著增加。这表明 ccIRF8 在鲤鱼的先天抗病毒和抗菌免疫反应中起着关键作用。同时,研究还确定了 ccIRF8 在 IFN 信号通路中的正调控功能以及在 NF-κB 信号通路中的负调控功能。这些发现不仅有助于深入理解 IRF8 在鱼类免疫系统中的调控机制,还为探索鱼类疾病控制的有效方法提供了新的思路,对鲤鱼养殖业的健康发展具有重要的理论指导意义。
涓嬭浇瀹夋嵎浼︾數瀛愪功銆婇€氳繃缁嗚優浠h阿鎻ず鏂扮殑鑽墿闈剁偣銆嬫帰绱㈠浣曢€氳繃浠h阿鍒嗘瀽淇冭繘鎮ㄧ殑鑽墿鍙戠幇鐮旂┒
10x Genomics鏂板搧Visium HD 寮€鍚崟缁嗚優鍒嗚鲸鐜囩殑鍏ㄨ浆褰曠粍绌洪棿鍒嗘瀽锛�
娆㈣繋涓嬭浇Twist銆婁笉鏂彉鍖栫殑CRISPR绛涢€夋牸灞€銆嬬數瀛愪功
鍗曠粏鑳炴祴搴忓叆闂ㄥぇ璁插爞 - 娣卞叆浜嗚В浠庣涓€涓崟缁嗚優瀹為獙璁捐鍒版暟鎹川鎺т笌鍙鍖栬В鏋�
涓嬭浇銆婄粏鑳炲唴铔嬬櫧璐ㄤ簰浣滃垎鏋愭柟娉曠數瀛愪功銆�