染色体分布与基因复制:进一步研究发现,这 10 个基因在甜瓜的 12 条染色体上分布并不均匀。同时,研究人员还发现了基因复制的痕迹,其中转座重复复制(TRD)在 SPS 和 SUS 基因家族的进化中发挥了重要作用,这表明基因复制是基因家族扩张和功能多样化的重要驱动力。
保守基序与基因结构:对基因的保守基序和结构进行分析后发现,进化关系相近的 SUS 和 SPS 基因往往具有相似的结构和基序组成。不同基因的内含子和外显子数量存在差异,但同一亚家族内的基因在这方面具有相似性。这一结果说明,这些基因在进化过程中,其结构和功能逐渐分化,但在亚家族内部仍保持着一定的保守性,以维持特定的生物学功能。
miRNA 靶标与基因本体分析:研究人员还发现,多个 miRNA 可以靶向 SPS 和 SUS 基因,参与调控它们的表达。基因本体(GO)分析则揭示了这些基因在分子功能、细胞组成和生物学过程等多个方面的作用,包括离子结合、蔗糖合成酶活性、蔗糖 - 磷酸合酶活性以及参与多种生物合成和代谢过程等。这表明 SPS 和 SUS 基因在甜瓜的生长发育过程中参与了复杂的调控网络。
基因表达模式:通过对不同组织和果实发育阶段的基因表达分析,研究人员发现部分基因在多种组织中均有较高表达,而部分基因的表达则具有组织特异性。在果实发育过程中,不同的 SPS 和 SUS 基因呈现出不同的表达模式,且这些基因的表达与蔗糖积累密切相关。例如,在果实成熟阶段,部分 SPS 基因的表达增加,这可能与蔗糖在果实中的积累有关。此外,研究还发现氮(N)和磷(P)的施用能够显著影响这些基因的表达,进而影响蔗糖的积累。