近年来,长读长测序因其可准确读取复杂区域的序列结构、覆盖传统测序技术无法触及的区域而备受关注,它能够帮助获取更完整的基因组信息,并已在大基因组拼接、甲基化研究、全长转录组、大片段结构变异、突变鉴定以及微生物快速鉴定方面取得了诸多进展。在长读长测序过程中,核酸片段的完整性及纯度对文库的成功构建及结果分析的准确性非常重要。针对长片段DNA的提取,QIAGEN有多款基于磁珠法、阴离子交换树脂技术和盐析法的提取方案,能够通过简便快捷的操作步骤,实现从血液、细胞、组织、拭子、细菌或酵母等多种样本中提取高质量的长片段DNA,广泛应用于诸如人类Y染色体测序[1-2]、人类泛基因组测序[3]等多个重要相关研究项目。想要进一步了解这些试剂盒的独特之处吗?今天,小编就带着大家来一探究竟!

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  MagAttract HMW DNA Kit

MagAttract HMW DNA Kit基于磁珠法技术,可从血液、细胞或组织等样本中提取平均片段长度>150kb的DNA,这款试剂盒将高性能的磁珠与创新的二氧化硅核酸吸附介质充分结合,确保能够获得更高产量及纯度的DNA,并具有极为快速简便的操作流程。此外,试剂盒所采用的温和的裂解条件,相对于其他同类磁珠法提取方案,在保证更高产量的同时,也能极大限度保护了DNA的完整性,降低了DNA的片段化程度。

另外,值得一提的是,该款试剂盒还能有效地去除样本中可能携带的污染物和抑制剂,进一步保障了下游PCR或建库实验的有效进行。


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  Blood & Cell Culture系列试剂盒

Blood & Cell Culture系列试剂盒基于QIAGEN领先的阴离子交换树脂技术,可从血液、细胞、细菌、酵母或组织等多种样本中提取长达150kb的DNA。在裂解过程中试剂盒配备的蛋白酶能够温和地消化掉核酸酶、组蛋白、DNA结合蛋白以及可能污染的病毒颗粒等蛋白,在缓冲液提供的pH和低盐条件下,DNA与阴离子交换树脂柱特异性结合,洗涤掉其他杂质后,高纯度的DNA在高盐缓冲液中洗脱下来。

此外,Blood & Cell Culture系列试剂盒提供Mini、Midi、Maxi三种不同的规格,能够灵活满足1-20ml血液或5X106-1X108个细胞的提取需求,核酸产量最高可达400µg。同时,整个提取过程无需苯酚和氯仿等有毒试剂,不仅更加安全方便,也使得提取得到的核酸具有更多突出的纯度标准,非常适用于对于核酸纯度具有更高要求的应用。


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  Puregene系列试剂盒

Puregene系列试剂盒则是采用盐析法进行长片段DNA的提取,能够从血液、细胞或组织中提取~100–200kb的DNA,操作流程简单,并具有更高的性价比。按照样本类型,Puregene系列可提供三款试剂盒。

以上便是QIAGEN目前最为畅销的三款长片段DNA提取方案的简要介绍。

想要了解这些试剂盒的更多细节么?想看看它们内部有何玄机吗?欢迎观看下方-QIAGEN“星品”系列开箱视频,如需获取更多信息,可扫描以下二维码提交您的反馈。

以上便是我们针对“长读长测序”应用的DNA提取方案介绍,关注 “凯杰生命科学” ,后续我们还将带来针对“长读长测序”的系列解决方案,敬请期待!

参考文献:
[1] Arang Rhie et al.,(2023) The complete sequence of a human Y chromosome. Nature.
[2] Pille Hallast et al.,(2023) Assembly of 43 human Y chromosomes reveals extensive complexity and variation. Nature.
[3] Wen-Wei Liao et al., (2023) A draft human pangenome reference. Nature.

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