AAV衣壳蛋白在基因治疗和疫苗开发中发挥着重要作用,但传统定向进化筛选技术存在着文库容量有限、成功率低、筛选效率低等诸多局限性,为此,我们通过深度学习建立了可预测的AI模型,以高效筛选用于基因治疗药物多目标性的AAV突变体,实现大脑靶向、全眼表达能力、眼部穿透力等多部位靶向预测。
相比于传统定向进化,AI辅助筛选AAV完成了多维度突破,即:
文库容量从有限到无限
以AAV9
561-588氨基酸区域突变文库为例,DNA文库最大容量为10⁹,通过AI深度学习筛选的序列容量可达到10⁵⁰。
使用AI模型而非湿实验来输出新序列
利用AI分别对高产量、组织靶向等参数进行筛选,再将数据通过算法合成来实现人工智能模型的训练,有效避免了传统湿实验中受限于文库合成容量的弊端。
周期由至少3年缩短至1年左右
筛选效率提高3-6倍
为了获得最优的突变体,往往需要进行3-6轮从文库合成到筛选的实验,利用AI技术可通过1-2次筛选即获得足够多的数据。
大脑靶向预测
图1. AAV大脑靶向预测
图2. 进行3E11vg/mouse的尾静脉注射,并在3w后检测
全眼表达能力预测
图3. AAV全眼表达效率预测
图4. 进行1E10vg/眼的玻璃体腔注射,并在27d后取材检测全眼anti-VEGF蛋白水平
眼部穿透力预测
图5. AAV眼部穿透力效率预测
图6. 进行3E9vg/眼的玻璃体腔注射,并在18d对其眼底荧光拍照,21d取材视网膜切片检测病毒表达效果
赛业生物可提供从AAV载体的设计、构建,到病毒的包装、纯化、表达分析以及功能验证等服务,为客户最大限度缩短实验周期。多种滴度规格可选,且采用严格的纯化工艺,有效实现外源human/mouse
ORFs、shRNA、lncRNA和CRISPR/gRNA的表达。
活动时间:2023年6月14日——8月14日
活动内容:订购以下病毒包装服务即享6.18折优惠价,快至2周,且免费赠送常规对照病毒。
服务类型
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规格
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滴度
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折后价
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订购
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AAV病毒包装
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1E+12GC
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≥5E+12GC/ml
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3880元
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5E+12GC
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≥1E+13GC/ml
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7780元
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1E+13GC
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≥1E+13GC/ml
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11080元
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彩蛋
更高规格的AAV病毒包装也有超值好价等你来,除此之外,还可提供慢病毒、腺病毒等类型的病毒包装,速来联系我们吧。
AAV体外感染细胞
我们将AAV2、AAV8、AAV9分别以MOI=1E5、1E4、1E3、1E2感染293T细胞,48h后能观察到明显的荧光强度,其中AAV2(MOI=1E5)的GFP阳性率达到99.66%。
包装得到了病毒,但实验还远远没有结束,在动物体内进行注射,以及后续的一系列有效性评估,对项目的成败也有着重要的影响。赛业生物可提供多种针对大小鼠的AAV病毒注射,包括常见的尾静脉、腹腔、眼、脑、肌肉等各种局部注射;并为你接入下游的药物药效服务平台,通过生理生化分析、病理学分析、代谢分析、基因与蛋白表达分析、细胞功能检测等检测实验,让你更好地利用表型验证得出准确的研究结论。