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生物分子凝聚体Biomolecular condensates:细胞内部分子通过多价弱相互作用聚集在一起,发生液-液相分离(liquid–liquid phase separation,LLPS)从而产生含蛋白质DNA和RNA的液状液滴。例如包含tsRNA、miRNA的P小体,包含m6A mRNA、tsRNA的压力应激颗粒等等。

HyPro相比CHIRP、RNA pull down技术优势

适用范围广,可研究mRNA/ncRNA/eccDNA/R-loop结合的蛋白、RNA、DNA,不需要过表达
既适用于强相互作用,也适用于空间弱/瞬时相互作用,最适合研究相分离和condensate
在细胞内完成标记,特异性高,标记背景低,能反映细胞内真实互作状态
样本需求量低4x10^7个细胞

HyPro-MS、HyPro-seq/芯片的应用方向

靶向mRNA/miRNA/LncRNA/CircRNA/tsRNA的空间互作蛋白、DNA、RNA
探究RNA-蛋白复合体在液-液相分离形成condensate过程中的动态变化和功能
研究由多种enhancer RNA/SE-lncRNA和蛋白组成的超级增强子的结构和功能
探究m6A mRNA结合reader影响condensate形成及功能(转录/剪切/稳定性/翻译)

讲座安排:
2023.08.03(周四) 14:00--16:00


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