Visium HD能够将全转录组空间基因表达的能力与单细胞分辨率相结合,发现组织中微米级的独特生物学见解。通过易于运行、基于CytAssist的工作流程,获得一流的数据质量。
借助Visium HD,成为空间探索新时代的先行者之一。基于无偏全转录组空间分析的可靠价值,Visium HD使您能够以革命性的分辨率和数据质量揭示FFPE组织样本中微米级的独特生物学特性:
在单细胞分辨率上进行全转录组基因表达分析,并具有连续的组织覆盖率。
利用Visium CytAssist实现行业领先的转录本定位,来生成超高质量的空间转录组数据。
Visium HD与含有mRNA的人类和小鼠福尔马林固定石蜡包埋 (FFPE) 组织切片兼容。这包括存档的FFPE蜡块和载玻片上的预先切片的组织。我们计划未来将样本扩展到其他组织条件。
Visium HD空间基因表达与用于形态学分析的苏木精和伊红 (H&E) 染色以及用于蛋白质共检测的免疫荧光 (IF) 染色兼容。可利用来自同一组织切片的高分辨率空间转录组学数据来提升对H&E和IF成像样本的分析。
Visium HD空间基因表达玻片包含两个6.5 x 6.5 mm捕获区域,其中寡核苷酸连续排列在数百万个无间隙的2 x 2 µm条形码标记的正方形中,实现单细胞级的空间分辨率。数据以2 µm正方形单位以及多个合并的分析单位输出。8 x 8 µm大小的分析单位是推荐的可视化和分析的起始点。
10x Genomics提供两种类型的软件来帮助您分析数据:Space Ranger和Loupe Browser。Space Ranger是一款分析软件,可自动将空间基因表达信息叠加在组织图像上,并识别具有相似转录特征的条形码标记的方块簇。然后,您可以使用Loupe Browser(一种可视化软件)以交互方式探索结果。您可以从10x Genomics支持网站免费下载Space Ranger和Loupe Browser。