 |
 |
 Takara分享 | 自动化、高通量全长单细胞转录组研究方案 基于二代测序技术进行单细胞转录组研究，既要求准确、高通量地进行单细胞平行处理，同时要求可用的文库构建试剂能够稳定、高效地完成对目标样本的建库工作。转录本末端捕获与全长转录本捕获两种建库方法，可以为不同的基因表达研究问题提供针对性答案。全长转录本捕获方法可以获得信息覆盖更均一的转录本，能够对基因融合、SNP检测、可变剪接进行细致地分析，为理解更深入的细胞生物学问题提供重要信息。Takara高通量单细胞分选系统ICELL8 cx Single-Cell System可以提供从单细胞分选到测序文库构建的完整解决方案，实现高通量、自动化的单细胞全长转录组研究！ ICELL8 cx单细胞全长转录组实验流程
• 基因融合检测案例（细胞系HCC2157） 转录本3’端捕获方法仅能检测到junction reads的信息；ICELL8 cx全长转录本捕获方法可以检测到junction reads和spanning reads双重信息，对融合事件有更灵敏的鉴定能力。
• SNP检测案例（细胞系HEK293） ICELL8 cx全长转录本捕获方法对ClinVar中致病SNP的覆盖率约为转录本末端捕获方法的32倍。即使在转录本3’端（（90, 100]），全长转录本捕获方法依然可以提供更高的SNP覆盖率表现。
注：ClinVar数据库中显示，HEK293鉴定到的致病性SNP更多地存在于基因的5’端。 • 文献案例Schoger, Eric, et al. CRISPR-mediated activation of endogenous gene expression in the postnatal heart. Circ Res. 126, 6-24(2019) |
| 更多产品详情请点击：
|
 |